江西斑点叉尾鮰养殖群遗传多样性及分子检测.pdfVIP

江西斑点叉尾鮰养殖群遗传多样性及分子检测.pdf

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摘要 摘要 采集江西省斑点叉尾鲴4个养殖群体共72个个体,利用AFLP技术研究斑 点叉尾鲴种群遗传多样性,并对主要的多态性片段进行克隆和测序及其同源性 分析。 研究成果和结论如下: I+3/Mse 1.从64对Ecog I+3引物组合中,筛选到条带清晰、多态性好的 组合20对,其中多态性信息含量高的4对引物组合共扩增出179个位点,多态 性位点数为109,占总数的60.89%。引物组E4/M7最好,多态性百分比为66.67%。 2.江西省斑点叉尾鲴4个养殖群体的遗传分化系数为0.1314,表明4个群 体间发生了一定程度的遗传分化。4个群体的Shannon多样性指数基本相同,平 均值为0.2910,说明遗传变异主要发生在群体内。AMOVA分析显示,群体的 遗传变异90.98%来源于群体内的个体间,9.02%来源于4个群体间。聚类分析表 明,四个群体所产生的遗传分化主要来源于种群内。 3.江西省不同养殖场的斑点叉尾鲴分化不够明显,只是由1个大的群体分 成若干小群体而已。 4.对多态性片段进行克隆和测序,在NCBI上共提交14个序列,大小在56- 248 bp,并获得序列号。这些序列与免疫和自身保护相关的基因、生长发育相关 的基因、能量与信号传导相关的基因和蛋白合成相关的基因等有关。综合分析 关键词:斑点叉尾鲴;遗传多样性;AFLP;分子检测 ¨ Abstract ABSTRACT Four ofchannel been cultured populations catfish(Ictaluruspunc肠tus)have collectedin total72individualsforresearchthe Jiangxiprovince geneticdiversityby meansof the havebeenclonedand AFLP,then importantpolymorphismsfragments and sequencedhomologyanalyzed. as Theresultsandconclusionsshowedfollows: 1.Thereare20 combinationshavebeenscreenedfromthe64 primer primer combinationsofEcoRI+3/Mse are and I+3,whose are stripsclearlypolymorphisms fine.Atotalof179lociwere four combinationswhose amplifiedby primer informationcontentsarericherthan 109were polymorphisms others,and locitook thetotal up6

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