Li^＋Be^2＋与NMA相互作用的理论研究.pdfVIP

第 38卷 第 3期 辽 宁师范大学学报 (自然科 学版 ) Vol_38 No．3 2015年 9月 JournalofLiaoningNormalUniversity (NaturalScienceEdition) Sep． 2015 文章编号 2015)030349—06 doi：10．11679／1sxblk2 Li+／Be2+与NMA相互作用的理论研究 宫利东， 李伟波， 任伟贺， 向 靓， 姚菁菁 (辽宁师范大学 化学化工学院，辽宁 大连 n6029) 摘 要：采用量子化学 B3Pw91／6—31+G(d，P)方法 ，对 Li。。／Be。。与氮 甲基 乙酰胺 (NMA)形成的M(NMA)(M—Li／Be ；n一1～6)团簇进行理论研究．优化得到多种 稳定结构 ，计算并比较不 同金属离子配位数下的结合能及 电荷分布．结果表 明：Be。与 羰基氧的距离R 一。比Li与羰基氧 的距离R。一。小；随着金属离子配位数 的增加，金 属与NMA 团簇 中羰基氧的距离RMo变大，内层 NMA上的羰基键长R。一。逐渐变小； 金属离子上所带的电荷随NMA分子数增加而减小． 关键词 ：金属离子；氮一甲基 乙酰胺 ；量子化学计算；结合能；电荷分布 中图分类号：O641．121 文献标志码 ：A 金属离子在生物化学过程中起重要作用_1。]，它可以增加蛋 白的活性 ，超过 1／3的蛋 白质必须以金 属离子作为辅助因子，金属离子可引导基 因与活性 中心结合 ，改变蛋 白质的空间构象 ，使其更适合发 生反应 ；还可以通过 电荷 的转移 ，控制酶促反应分步进行．因此详细分析金属离子与蛋 白质等生物分 子的作用模式很有必要．YesJ等_l6]利用离子束 串联质谱仪研究了Li。。、Na 、K。。分别与氨基酸 Ser、 Thr的结合能，结果表明：结合能大小顺序为 Li。。 Na。。 K。。，即结合能随金属离子半径的增加而 减小 ，但不同金属离子与氨基酸的结合能差距不大．Motoya等 应用密度泛函方法研究了 1～25个 丙氨酸分别与碱金属及碱土金属离子之间的能量学特征 ，发现 1价 的碱金属离子易与氨基酸形成多 聚肽复合物，金属离子与羧基端相互作用 ，其余部分采用螺旋构型；而2价的碱土金属离子则容易产 生多个断裂的螺旋结构 ；对于正 3价的In”，Sc”，Y ，氨基酸并不能与之形成复合物． 氮甲基乙酰胺 (NMA)中包含 1个酰胺基 ，可以将其作为蛋白质主链结构 中的 1个最简单且典型 的模板 ，有关金属离子与 NMA 相互作用 的研究也有一些文献 的报道 8。 ．MillerDJ等 通过对 Na。。、K 与 NMA一(H。O)：～。复合物结构的红外光谱和能量分析 ，发现具有 3个或更多的水分子 的 体系中，NMA 分子会移动 到第二溶剂 壳层 ，与水分子通过O—H…O—C氢键相 结合 ；特别是 K。。(NMA)(H：O)。复合物 ，该复合物的任意稳定结构一定有水 …水间氢键或水…NMA间氢键的存 在．HEYDAJan等 报道 了Na。。／K。。与液态 NMA 的分子动力学模拟 ，经研 究发现 Na ／K 与 NMA 中的羰基氧有强烈的亲和性 ，卤素离子与亚氨基上 的氢之间并无明显的吸引力，而 Br ／I离 子与甲基基团问却有着相互作用．目前 ，对于金属离子与 NMA相互作用 的研究 已有一些报道 ，本文 选取研究相对较少 的Li。-／Be。。离子与 NMA相互作用．NMA 的稳定几何构型有 2种 ，即反式 — NMA和顺式 c—NMA，很多研究都曾经指出f—NMA不及 t-NMA稳定_1．而且生物体内的肽键大多 收稿 日期 ：2015—05—12 基金项 目：国家 自然科学基金项 目；辽宁省高等学校杰出青年学者成长计划项 目(LJQ2013111) 作者简介：宫利东(1975 )，男 ，吉林舒兰人 ，辽宁师范大学教授 ，博士． 350 辽宁师范大学学报(自然科学版) 第38卷 数都是反式的，所 以选择 t-NMA作为研究对象．计算表明，除个别结构 之外 ，金