牛microRNA的计算机鉴定及其分析.pdf

摘要 区结合来调控靶基因的表达。目前己证实miRNA在生物体生长、发育和疾病发 生等过程中发挥着重要的作用。由于现在在各个物种中已鉴定的miRNA的数量 离实际的饱合值还很远，所以对miRNA的分离鉴定仍然是miRNA研究的一个重 点和热点。动物miRNA基因在进化上具有高度的保守性，许多序列都可以在亲 缘关系相近的物种中找到，甚至在亲缘关系较远的物种中都有发现。牛全基因 组的测序在2005年便已完成，这为计算机搜寻miRNA提供了前提条件。因而，我 们可以利用已鉴定的种子序列，通过生物信息学同源性搜索的方法来搜寻牛的 miRNA基因，并且应用软件搜寻候选基因的靶序列，系统分析miRNA的基因组 织形式。鉴定和分析牛miRNA基因及其靶基因，有助于我们进一步了解miRNA 对牛生长发育的影响与作用，有利于通过基因工程手段改良牛的品种与质量， 并增加经济效益。此外，通过全基因组比较分析，发现人与牛基因组具有相似 的核苷酸差异水平，这为研究人类相关疾病提供了一个较好的平台。 本文采用计算机RNA组学和实验RNA组学相结合的方法，利用成熟 miRNA的序列保守性以及前体结构具有发夹二级结构的特性在牛基因组中鉴定 出289个miRNA分子，现将研究结果小结如下： 1．所鉴定的289个