肺癌新基因的发现及其致病机理的研究.pdf

论文摘要 肺癌是一种常见的发生在肺部的恶性肿瘤，目前是因癌症死亡最常见病因之 一，全球每年约有130万人死于肺癌。肺癌患者5年生存率一直维持在14％不 变。在过去的20年。高通量技术应用于肺癌的研究产生了大量的数据，潜在地 为我们研究肺癌的分子机制提供了重要的资源。人类肺癌数据库HLungDB是一个 将肺癌有关的基因，蛋白质和miRNA以及临床资料等相应的数据整合在一起的数 据库。这一平台建立的主要目的是提供一个与肺癌有关的全面综合的网络资源， 以促进肺癌机理研究的发展。当前版本的数据库手动从文献中提取了描述分子和 人类肺癌的关系的数据。目前，我们通过文本挖掘收集了在不同阶段的肺癌中的 2585个基因和212个=iRNA的相关数据。此外，我们亦整合了转录因子，转录 因子结合位点，启动子，SNP等信息并存储在数据库中。由于表观遗传调控在肺 癌的发生中起到了重要作用，我们也收集了相关的数据。我们希望HLungDB数据 库能够丰富我们对肺癌的生物学知识的认识，并最终导致新的治疗肺癌的方案出 使用。建立在HLungDB数据库的基础上，我们从生物学通路角度对肺癌机理展开 了系统生物学的研究分析。在我们的研究中，我们分析表达谱的数据和现有的通 路有关的数据，使用因子分析和超几何分布两种方法获得了