蛋白质折叠，结构拆解与结合部位多样性的分析.pdfVIP

蛋自质折叠，结构拆解和结合部位多样性的研究 摘要 在生物信息学中，序列、结构和功能是蛋白质研究的三大信息源。序列与结构之间 的关系所构成的蛋自质折叠问题，以及结构与功能之间的关系问题是分子生物学极具挑 战性的研究课题。 本文对决定蛋白质折叠机制的结构因素进行了研究。认为蛋白质结构中氨基酸残基 对之间存在着一种排斥势能。当折叠时，蛋白质结构坍缩，排斥势能阻碍着残基相互靠 近，形成折叠反应势垒，致使折叠速率下降。 蛋白质和短肽进行统计，结果表明，势能与折叠速率常效具有强相关性，相关系数分别 为加．80和-o．8l。蛋白质结构中接触着的残基是影响折叠动力学的主要因素。 蛋白质结构，特别是三级结构是与生物功能密切相关的。但是，在蛋白质结构研究 中很难将二级结构与三级结构定量地区分开来。这里，我们以小波分析方法对蛋白质主 链进行高频去噪，只保留链的低频折叠。这就相当于将二级结构从蛋白质结构中剥离了 出去，只保留下“纯粹的”三级结构。该方法突出了蛋白质长程结构的特征，为蛋白质 结构的预测提供了一种数据来源。 在蛋白质结构和功能关系的研究中，蛋白质空间结构的叠合通常是困难的。选取不 同序列和结构的肌红蛋白，它们所结合的配体均为原卟