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毕业设计(论文)开题报告
学生姓名: 学 号:
所在学院: 生物与制药工程学院
专 业: 生物工程
设计(论文)题目: Glarea lozoyensis的
助教
2015年 1 月 10日
毕 业 设 计(论 文)开 题 报 告
1.结合毕业设计(论文)课题情况,根据所查阅的文献资料,每人撰写
2000字左右的文献综述: 文 献 综 述
纽莫康定简介
1.1棘白菌素类抗生素
因此这类药物可以有效的用于杀灭对氮唑类和两性霉素B 产生抗性的真菌。没有溶血毒性以及较少的药物相互作用也使得这类药物比传统的抗真菌药物具有更大的优势。明显不同于传统的抗真菌药物的作用机制。 现已发现多种棘白菌素类药物,按结构特征大致可分为三类:echinocandin 类、pneumocandin 类和含硫脂肽类。
1.2 纽莫康定B0——抗真菌药物卡泊芬净的前体
纽莫康定( Pneumocandin ) 类棘白菌素化合物是Merck公司科学家发现并命名的, 生产菌为Glarea lozoyensis[2],是由从西班牙马德里的洛索亚流域附近的水塘中分离出来的一株丝状真菌[],产的纽莫康定是一类由六肽和脂肪酸构成的酯肽[],主要有A0 和B0 两种有效产物。通过对药效较好的B0修饰,得到一种水溶性半合成衍生物泊芬净( Caspofungin ),商品名为赛克斯( Cancidas ),于2001年获FDA批准是第一个上市的棘球白素类药物。卡泊芬净目前已在70多个国家被广泛使用,对耐氟康唑的念珠菌、曲霉菌、孢子菌均有较强的活性。目前,该产品已成为全身用抗真菌药市场的王牌药物。
图1 纽莫康定B0和科赛斯的结构
微生物
2.1代谢组学的介绍
代谢组学是对生物系统中的相对低分子量代谢物进行全面、定性和定量的分析,考察生物体系受到刺激或扰动(如某一特定的基因变异或环境变化)后,其代谢产物的变化或其随时间的变化来研究生物体系的一门科学[6]。代谢物处于生物系统生化活动的末端,基因和蛋白质表达的微小变化会在代谢物上得到放大。而且科学家们逐渐认识到:基因组的变化不一定能够得到表达,从而并不对系统产生实质影响。某些蛋白质的浓度会由于外部条件的变化而升高,但由于这个蛋白质可能不具备活性,从而也不对系统产生影响。同时,由于基因或蛋白质的功能补偿作用,某个基因或蛋白质的缺失会由于其他基因或蛋白质的存在而得到补偿,最后反应的净结果为零[8]。而小分子的生产和代谢才是这一系列事件的最终结果,它能够更准确地反映生物体系的状态。因此代谢物是机体表型最好的指示剂[7],其包含着反映生理表型的直接而全面的生物标记物信息。
2.2微生物代谢组学的研究技术方法
微生物培养
快速取样
淬灭
代谢物的提取
一维或二维分(LC,GC,CE)
检测MS,NMR,IR
数据处理
生物学解释
图2(上图) 微生物代谢组学研究流程
2.2.1微生物的培养
培养基为微生物的生长及其代谢产物的形成提供必需的营养物质和能量,是影响发酵水平的重要因素之一。代谢组学因为是分析胞内产物,复杂的培养基成分会给胞内产物的分析带来干扰,虽然通过清洗细胞可以去除部分培养基,但是胞内代谢物的水平是微量,残余的培养基成分仍然会给分析带来误差,所以代谢组学的培养基一般要求成分确定的合成培养基。次级代谢产物由于代谢途径复杂,通常需要在营养成分丰富的天然培养基中生产,所以在建立纽莫康定B0高水平发酵过程之前,需要对培养基进行优化,以获得纽莫康定B0高产的合成培养基。
单因素法仍然是目前实验室最常用的试验方法,是逐个考察因素的优化方法。当需要考察的因素较多的时候,这种方法就需要繁多的实验组数和较长的实验周期,而且还可能因为实验批次的不同和实验条件的不统一,从而导致不可靠甚至错误的结果,尤其是对具有交互影响的多因素实验。然而因为操作简单、结果也能直观地用图表表示,因此单次单因子实验对实验设计是很重要的[9-10]。
正交试验设计应用的非常广泛,它相比于同因素同水平的单因素实验,正交试验次数明显要少,并且可以通过方差分析,得到影响实验结论的主次因素以及考虑因素之间的交互影响[11]。但是当考虑因素间的交互作用时,正交试验明显存在不足。同时正交试验在最终选取最优实验方案时,一般需要通过经验来去除不显著因素,这不适合于创新性
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