《三维基因组》.pdfVIP

生 命 科 掌 在基因组学领域，细胞核 目前仍是一个未知的领域，我们对于其动态性状了解得如此2 少是一件令人尴尬的事。为了解基因组的工作方式，仅知道DNA序列是不够的，我们还必须 研究染色体的结构—— 三维基因组 冯 凯 韩 龙 石 磊 ／编译 基因组学的下一个前沿是空间结构 ．即盘绕在 基因组研究 的生物学家彼得 ·弗雷泽 (PeterFraser) 细胞核 中的染色体的三维结构。染色体的空间结构 认为 。其中的远程相互作用似乎难 以让人置信。“即 并不是随机地将 2米长的DNA包装进一个横跨可 便有很多的结构 ，目前仍不清楚基因组的空间结构 能 l0微米 的球体 中。它是随细胞 的类型而变化 ，并 在扮演何种角色。人们过去假定 ，在细胞核中相距 5 对基因表达产生迄今仍很神秘的影响。德国慕尼黑 万个碱基 的序列不能彼此发现。” 路德维希马克西米利安大学的遗传学家托马斯 ·克 现在 ．科学家知道这种远程相互作用一直在发 莱莫 (ThomasCremer)说，破译染色体三维结构对功 生 。2002年 ，弗雷泽 的实验室成为 了首批检测到 “远 能的影响将面临很多困难 ，尤其是研究人员仍在尝 程环状相互作用 ”的实验室之一 ，该作用能使基因 试发现染色体是如何随细胞变化而改变的。克莱莫 序列与远处的调控元件发生物理接触．包括失活的 自1970年代 以来一直在研究基 因组 的空间结构 ， 染色质通常被分流到细胞核的边缘 (在老鼠的视网 他说 ：“细胞核仍是一个未知的领域 ，我们对于其动 膜细胞中这种排列是相反 的)，能使更多的光到达 态性状 了解得如此之少是一件多么令人尴尬 的 视网膜 的光受体。 事。” 基因组 的空问结构是非常重要的．如果发生改 近几十年来已知的基本知识是 ：DNA双螺旋盘 变，将会带来严重后果。例如 ，一种被称为 “伯基特 绕着被称为 “组蛋白”的蛋 白质而形成 “染色质”链 ， 氏淋巴瘤 (Burkitt’Slymphoma)”的淋 巴系统癌症 ， 染色质链再装配成染色体 。但是 ，当提到染色体 自 是 由第 8号染色体 中的一段 “竖”在第 l4号染色体 身的扭 曲和旋转时，英国剑桥 巴布拉汉研究所从事 上导致的，反之亦然。发生这样的情况 ，是因为 白细 胞 中的染色体排列 自身 的方式出了问题——转录 期间集合在一起 的基 因其发生染色体易位的频率 更高。已经发现 ，多种类型的癌症都与影 响染色质 结构 的蛋 白质发生突变有关。研究人员推测 。不编 码基因的DNA片段 中发生的与疾病有关 的突变 。 能够改变远程相互作用 。 结构 中的答案 研究人员很早就已知道 。DNA序列和组蛋 白被 “贴上”了化学修饰的 “标签”，这些修饰在 “打开”或 荧光原位杂交能显示 出细胞核 中基 因的位置 。 “关闭”基因的同时，可 以给这些 “表观遗传”修饰进 图为人类第 l6号染色体上一个富含基 因区域 (含 行分类 。新加坡基因组研究所的生物学家阮一俊 50万个碱基)的球形构象 (音译)认为，染色质 的三维结构反映了表观遗传调 ■ ．． 皇兰 ：