大麦Dhn6基因的克隆、蛋白质结构预测与干旱胁迫表达模式.pdfVIP

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  • 2016-01-19 发布于河南
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大麦Dhn6基因的克隆、蛋白质结构预测与干旱胁迫表达模式.pdf

大麦Dhn6基因的克隆、蛋白质结构预测与干旱胁迫表达模式.pdf

遗 HEREDITAS(Beijing)2011年3EJ ISSN0253-9772 WWW.chinagene.ca 研究报告 DoI:10.3724/SP.J.1005.2011.00270 大麦Dhn6基因的克隆、蛋白质结构预测与干旱胁迫表 达模式 钱刚 ,平军娇 ,张珍 ,罗素元 ,李学英 ,杨明镇 ,张达 1.遵义医学院细胞生物学与遗传学教研室,遵义 563000; 2.遵义医学院附属医院介入科,遵义 563000; 3.东北农业大学生命科学学院植物生理学研究室,哈尔滨 150030 摘要:脱水素(Dehydrins,DHNs)是高等植物胚胎发育晚期产生的一类特异多肽,其表达累积程度与植物的发 育阶段、低温、ABA和脱水信号调节等因素密切相关。为了解脱水素的结构与干旱胁迫表达累积反应,文章从 六棱大麦分离到序列全长为 1767bp的 Dhn6基 因,序列分析结果表 明,该基因含一个 92bp 内含子, 90~1759bp为一个开放阅读框,与裸大麦Dhn6基因(GenBank登录号:AF043091)~同源性最高,达93.18%,编 码 523个氨基酸残基的多肽,预测蛋白质的分子量为49.68kDa,理论等电点为8.04。结构分析发现,蛋白质具 有 3个螺旋区,无规则卷 曲构成二级结构的主要组分,亲水氨基酸比例超过 83%;三维结构预测发现,多肽链 自身反向平行排列成松散的亲水索链,K.片段参与兼性 .螺旋结构域的形成,意味着该脱水素具有束缚 自由 水、稳定细胞膜相结构的功能。实时定量RT-PCR检测结果表明,Dhn6基因的相对表达水平在干旱处理 8h快 速累积,推测DHN6在大麦对干旱胁迫的早期响应中发挥重要功能。 关键词:大麦;Dhn6基因;结构预测;兼性 .螺旋结构域;干旱胁迫 Molecularcloningandproteinstructurepredictionofbarley(Hordeum vulgrareL.)Dhn6geneanditsexpressionpatternunderdehydration conditions QIANGang,PINGJun—Jiao,ZHANGZhen,LUOSu.Yuan,LIXue.Ying, YANG M ing.Zhen ,ZHANG Da3 1.DepartmentofCellBiologyandGenetics,ZunyiMedicalCollege,Zunyi563000,China; 2.DepartmentoflnterventionalRadioloyg,theAffiliatedHospitalofZunyiMedicalCollege,Zunyi563000,China; 3.LaboratoryofPlantP siology,CollegeofLifeScience,NortheastAgriculturalUniversity,150030,China Abstract:Dehydrins(DHNs),proteinswithprotectivefunctionsencodedbythelateembryogenesisabundant(LEA).are differentiallyup-regulatedatthetranscriptionallevelunderenvironmentalsrtessessuchaswaterdeficit.salinity.andlOW temperatureorinresponsetoABA.Datainvolvingproteinstructureandexpressionofdehydrinscouldelucidatehteirfunc. tionalrolesunderdehydrationconditionsinplants.Dhn6geneof1767bDwithna intron(92bp)insix.rowedbarley,a memberofLEA Dl1,wasclonedintopMD18-Tvectorinthepresentstudy.Itshraed93.18% identitywith rdeum vul- garessp.vulgate(GenBankaccession:AF043091),encodingaproteincomposedof523aminoacidresidueswithhtepre— dietedmolecularweightof49.68kDaandhtetheoreti

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