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行星流体动力学数值模拟程序的千核性能优化

e-Science 技术 TECHNOLOGY 行星流体动力学数值模拟程序的行星流体动力学数值模拟程序的 千核性能优化千核性能优化 1,2 1 1,2,3 1 4 张云泉 ,王 婷 ,孙相征 ,杨超 ,李力刚 1. 中国科学院软件研究所并行软件与计算科学实验室,北京 100190 2. 中国科学院软件研究所计算机科学国家重点实验室,北京 100190 3. 中国科学院研究生院,北京 100190 4. 中国科学院上海天文台,上海 200030 摘 要: 基于百万亿次超级计算机深腾7000,对行星流体动力学数值模拟程序的性能 优化进行了研究。首先,进行了从原基于Aztec库到PETSc库改进后的程序的 8-2048核强可扩展性测试。测试结果表明,在每节点8核或4核时,PETSc程序 运行时间平均是Aztec程序29.31%或24.97%。其次,针对该程序压力方程的 系数矩阵特点,设计实现了CVRSD存储格式的SpMV优化,下一步将移植到基于 PETSc库的行星流体动力学程序中。 关键词: 天体数值模拟;深腾7000;性能测试;可扩展性;优化 Performance Optimization of Planetary Fluid Dynamics Numerical Simulation Program on Thousands Cores 1,2 1 1,2,3 1 4 Zhang Yunquan , Wang Ting , Sun Xiangzheng , Yang Chao , Li Ligang 1. Lab. of Parallel Software and Computational Science, ISCAS, Beijing 100190, China 2. State Key Lab. of Computer Science, ISCAS, Beijing 100190, China 3. Graduate University of Chinese Academy of Sciences, Beijing 100190, China 4. Shanghai Astronomical Observatory, CAS, Shanghai 200030, China Abstract: The performance optimization of planetary fluid dynamics numerical simulation program on thousands cores is investigated by the experiments on 100TFlops-scale supercomputer,

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