产电微生物基因达谱及调控机制分析.pdf

摘要 摘要 论文题目 产电微生物基因表达谱及调控机制分析 作者姓名 付亚星 导师姓名 孙啸(教授) 学校名称 东南大学 能源匮乏和环境污染是当今两个全球性问题，寻求可再生能源和环境治理成 fuel 为生物技术研究的主要推动力。微生物燃料电池(microbialcell，MFC)是 一种能量转化的新技术，利用细菌降解有机物，同时产生电能。MFC在废水处 理、可再生能源、环境治理等多个方面具有重要应用潜质。然而目前MFC的产 电效率还不够高，技术还不够成熟。决定MFC产电效率的最本质因素是阳极微 生物的种类及特性。本文的目的就是通过产电微生物基因表达谱分析来研究其产 电机制，发现与产电功能密切相关的基因，并构建电子传递相关基因的调控网络， 为产电微生物的基因工程改造、MFC产电效率的提高提供科学依据。 本文选取两种模式产电微生物Geobacter sulfurreducens oneidensis MR-1作为研究对象，利用显著差异表达分析，发现并深入研究对电 子传递起关键作用的基因；通过相关性分析，探索电子传递相关基因之间未知的 表达调控关系；结合基因组及注释代谢等信息进行基因功能注释，确定挖掘出的 基因的功能；构建关联网络和贝叶斯网络，论证并可视化基因间表达调控关系。 G 对于生物膜还原能力的增强及电子的传递具有重要作用。推测转运载体相关蛋白 与外膜孔蛋白ompJ相关基因具有较高的序列相似度。脱氢酶砂M和hybS、双 oneidensis S02727和延胡索酸盐还原酶黄 分泌相关的胞质易位蛋白tatA．tatC、细胞色素e3 素蛋白前体S00970等，对电子的胞外传递具有重要影响。功能未知的蛋白 S04031和S02992与已知的功能基因具有密切的相关关系，为我们进一步确定 这些基因的功能提供了依据。相关性及网络分析显示CzcA重金属流蛋白S04598 和MR-1中电子传递相关基因之间新的表达调控关系，并进一步验证了电子传递 和趋化基因(如S03582、S02240等)之间的共表达调控关系。 关键词：微生物燃料电池，胞外电子传递，基因表达谱，相关性分析，基因 调控网络 Abstract Abstract THESIS of and mechanismsfor TITLE：Analysisgeneexpressionprofileregulatory electricigens GRADUATESTUDENTNAME：FU Yaxing SUPERVISOR：SUN Xiao(Professor) SCHOOL：Southeast University 11坨lackoffossilfuelsand thetwomain are pollution globleproblems．Thediscovery ofrenewableandenvironment as for energy remedation，alemajorimpetus acting researchinto fuel anovelmethodfor biologicaltechnologies．Microbialce