测序芯片中的高度分子点阵的图像处理.pdfVIP

摘要 论文题目 测序芯片中的商密度分子点阵的图像处理 作者姓名 钱lE瑛 导师姓名 陆祖宏教授 学校名称 东南大学 随着人类基因组计划的完成，DNA铡序开始发挥其重要的作用。传统的测序方法有：板凝胶电 泳法和毛细管电泳法；新一代的测序方法有：杂交测序，合成测序和单分子测序。如何能够快速、 准确、高通鼍的实现DNA测序是将来研究的重点。基冈芯片与DNA测序的结合，使得以上这些要 求都将成为可能，而且可以大人降低成本。我们采_L}】滚环扩增方法制备测序模板，然后通过合成测 序的方法进行DNA序列的检测。 在对测序芯片的研究过程中，需要生物信息学的分析，生物芯片图像处理即是这个过稃中的一 个重要部分。特别是对于不同生物芯片上的人晕分子特征荧光点进行识别、分析和配准，将特征点 的灰度信患联合起来。就可以得到待测DNA的序列。 本文主要针对芯片I璺|像分析中的算法进行研究，对测序芯片的图像处理，对分子特征荧光点进 行识别、分析和配准。主要研究i．作分为二个方面： (1)对芯片图像上特征点的提取，这里研究了两人类方法：边缘提取和阈值分割，在不同的 芯片图像中采用不同的特征点提取的方法。边缘提取方法主要研究四种经典算子：