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大白菜端粒相关列的克隆及不同染色体fish标记的建立
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Y21
43683
摘要
重复序列是真核生物基因组的一个重要组成部分,不仅对维持染色体的空间结
构、基因的表达调控、遗传重组等都具有重要作用,而且串联重复的DNA簇往往具
有种属甚至染色体的特异性。因此,克隆和分析重复序列是研究一个真核生物基因组
的有效手段。大白菜(Brassica
campestris
(Brassica)中最重要的蔬菜作物之一,属二倍体物种。此外,大白菜为小染色体物
种,且非同源染色体形态相似。建立有效的染色体识别方法是进行核型分析和细胞遗
传学研究的重要前提。但目前为止,利用有丝分裂中期染色体,基于rDNA为探针的
FISH核型分析,可把大白菜10条染色体中的6条准确区分出,但仍有4条染色体难
以识别。基于此,本研究以拟南芥重复序列为引物,以大白菜自交系‘85.1’基因组
DNA为模板进行PCR扩增,对大白菜端粒相关序列进行了克隆和测序分析;并以锚
定大白菜不同染色体的BAC克隆为探针,在大白菜中期染色体进行FISH,结合45S
rDNA、5S
rDNA及着丝粒重复探针的FISH结果,构建了精确识别大白菜不同染色
体的FISH标记核型图。主要研究结果如下:
于大白菜2号染色体的近末端,该序列不仅含有拟南芥类型端粒重复单元,还含有其
他生物的端粒重复单元。
2.5S
rDNA探针在大白菜染色体上共检测到了lO个杂交信号,分别位于1—3号、
rDNA探针在大白菜
5号染色体长臂的近着丝点区域和10号染色体的短臂末端;45S
染色体上同样检测到了10个杂交信号,但所位于的染色体及部位有所不同,分别位
于1~5号染色体长臂近着丝点区域。
3.大白菜CentBrl着丝粒重复探针在大白菜中期染色体上共检测到了16个杂交
复探针探针在大白菜10对染色体上共检测到了4个杂交信号,分别位于第2对染色
体长臂近着丝点处和第5对染色体长臂的末端。
4.除A1连锁群外,其他9个连锁群筛出的BAC克隆分别在大白菜9对同源染
色体上各出现了1对杂交信号,确定了大白菜染色体和连锁群的对应关系,其中
记的染色体核型模式图。
关键词:大白菜;端粒相关序列;FISH;BAC克隆;染色体核型
ofTelomere
AssociatedandEstablishmentofChromosome
Cloning Sequence
in
FISHMarkersChinese
Specific Cabbage
Author:LiJiuhuan
Major:Olericulture
Tutor:Shen
Shuxing
XuanShuxin
of of 100
1,China)
(CollegeHorticulture,AgriculturalUniversityHebei,Baoding,07
Abstract
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