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棉花黄萎病抗性分子标记研究.pdf

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棉花黄萎病抗性分子标记研究

摘 要 以陆地棉TM.1和常抗棉配制种内杂交组合构建R1L作图群体,通过SSR分子标记技术手 段进行陆地棉遗传连锁图谱构建和黄萎病抗性QTL定位研究。为提高试验的精准度,在研究过 程中分别选取大田和病圃作为棉花黄萎病病指鉴定的不同环境条件,且每个条件下又设3次重 复试验,结果发现,大田环境下调查所得病指符合正态分布规律,而病圃中得到的数据存在偏 分离现象,这与病圃鉴定时感病植株的易丢失有关,对于存在偏分离现象的表型数据用DPS软 件校正之后仍然用于陆地棉抗黄萎病QTL定位研究。 选取8454对SSR引物对2个亲本进行标记基因型分析,多数SSR引物在陆陆品种间多态 性水平较低,表现多态性的引物数量仅有1.43%。为提高陆地棉抗黄萎病分子标记研究的工作 效率,从现有基因组数据库中共收集到19条植物抗黄萎病基因及其相关序列,用于开发具有针 引物,将其用于分子标记基因型分析时,有3对引物能够在2亲本间表现多态性。 以RILs为作图群体构建遗传连锁图谱,所得图谱含有10个连锁群,总标记数为85个,覆 3-14个,各连锁群的长度位于3.2-131。9cM之间。为获得高密度遗传连锁图谱,将该图谱同 TM-lx常抗棉衍生的F2群体构建的棉花抗黄萎病遗传连锁图谱进行整合,整合之后得到的图谱 包含10个连锁群,共有标记数95个,标记间平均距离为6.9cM,覆盖基因组全长的661.1cM。 同时发现,连锁群数目与陆地棉单倍体的染色体数目不等的现象。 应用软件WmQTLCart V2.5进行陆地棉抗黄萎病QTL检测,当LOD值设为6.0时,复合 区间作图法可以检测到2个试验环境条件下共6个陆地棉抗黄萎病QTLs,其中效应值较大的2 个QTLs全部位于第6连锁群上,可以分别解释表型变异的37.51%、47.25%。 选取QTL定位分析中获得的抗病QTLs及其紧密连锁标记18个,用于分子标记辅助选择 无标记基因型个体间病指差异显著,且选择效应能够在不同世代间稳定遗传。通过对单标记、 多标记选择效应比较,发现不同标记间配制辅助选择最优组合可以实现选择效应的最大叠加, MAS技术可以提高陆地棉黄萎病育种的选择效率、加快育种进程。 关键词:棉花黄萎病,分子标记,遗传图谱,RILs,MAS Abstract RILscreated between cottonand A cotton SSR by TM一1,using Upland crossing changkang an verticilliumwilt in marker toconstruct coRon andsearch QTLs technology Upland geneticmap of common cotton.Inorderto the selected field Upland improveaccuracyarray,thisstudy breeding index anddisease asdifferentenvironmentalconditionsto cottondisease nursery identify against verticilliumwiltand testenvironmentincludes3 resultsshowedthat

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