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板栗aflp银技术体系建立及遗传多样性研究
摘要
MiLer)植物,在我国南北皆有分布,
板栗为壳斗科(Fagaceae)栗属(Castanea
是我国的特色果树。板栗是原产我国的重要干果之一,种质资源非常丰富。但由于
长期实生繁殖,品种命名标准不一,造成品种资源底码不清,同名异物
或同物异名现象严重,给板栗资源研究、保存、评价、利用及新种质的
创新等带来很大困难。尽管前人利用分子标记对板栗也进行了一些研
断长度多态性)是一种新的DNA分子标记技术,具有丰富的多态性、较
好的稳定性和较高的个体特异性,广泛应用于品种鉴定、遗传多样性分
析、遗传图谱构建、基因定位等方面。本试验在建立较稳定的板栗AFLP
银染技术体系基础上,筛选出22对谱带清晰、多态性好的引物组合,
构建了47份板栗材料的指纹图谱,分析了其遗传多样性,以期为板栗
品种鉴定、亲缘关系分析、高密度遗传图谱构建、核心种质构建等奠定
基础。
主要研究结果如下:
1.针对板栗叶片组织中酚类物质、多糖、蛋白质等含量较高的特点,
采用改良的CTAB法,并添加不同的抗酚类氧化褐变物质,筛选出适宜
取液中加入2%CTAB,3%PVP一40,1%B一巯基乙醇,20mmol/LNa2S205等
物质,所提取板栗DNA纯度高、基本无降解,适于AFLP分析要求。
2.通过对板栗AFLP银染技术体系进行系统研究,建立了适于板栗
Buffer
EcoRI和MseI各3U、MseI
以去除内切酶活性。变性后的酶切产物加入5pL连接液,并在PCR仪
上37℃保温12h。其中连接液包括:MseI
1.0BL,EcoRI
ligase(3U·uL“)0.7pL,T4Buffer0.5pL,ddH20O.29L。连接完成后,将
之后,连接产物稀释lO倍进行预扩增。预扩产物稀释lO倍进行选扩。
选扩完成后,加入10 Loading
pL
却,置于一20℃保存备用。取8pL变性的选扩产物在6%的聚丙烯酰胺凝
胶上进行电泳。电泳完成后,进行银染程序:固定、冲洗、染色、冲洗、
显影、固定、冲洗、室温干燥等。
进行选择性扩增,从中筛选出多态性较好、电泳谱带较为清晰的22对
引物组合对47份材料进行AFLP分析。
4.利用筛选出的22对引物组合,共扩增出1959条带,其中多态性
材料的DNA指纹数据库。采用二岐分类法确定样品在AFLP指纹图谱中
的差异带,根据各自差异带可以将供试样品~一区分开,并且部分品种
(品系)具有自己的特征带,可作为该材料基因型鉴定的依据。
5.采用离差平方和方法计算样品间的遗传距离。利用此遗传距离
分为两个大的类群。聚类结果表明,供试材料间遗传背景复杂,且聚类
结果与材料的地理来源没有明显的联系。
关键词: AFLP银染技术体系;指纹图谱;遗传多样性;板栗。
TheEstablishmentofAFLP Studies
and on
Silver-stainingAnalysisSystem
Genetic in
Chestnut
Diversity
Major.Pomology
Master:.FAN
Li-jing
Supervisor:WANGWen-jiang
Abstract
fragmentlength anewDNAmolecularmarker
AFLP(amplified polymorphism)is
with and h
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