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一种肿瘤基因的支持向量机提取方法.pdf

2012年2月 西安电子科技大学学报自然科学版) Feb.2012 OFXIDIAN V01.39No.I 第39卷第1期 JOURNAL UNIVERSITY doi:10.3969/j.issn.1001—2400.2012.01.034 一种肿瘤基因的支持向量机提取方法 秦传东1,刘三阳2,张市芳1 (1.西安电子科技大学计算机学院,陕西西安710071I ‘ 2.西安电子科技大学理学院,陕西西安 710071) 摘要:根据结肠癌肿瘤基因表达谱样本高维数、小样本和高噪声的特点,提出用Bhattacharyya距离对肿 瘤基因进行测量,滤除分类无关基因,然后用肿瘤基因对支持向量机模型的敏感度进行二次提取.并用它 的归一化值对重要基因赋权,形成只有少数重要致病肿瘤基因的新样本集.最后,支持向量机应用于对新 样本集的特征基因进行分析与测试.实验证明这种分析方法提高了肿瘤诊断的准确率. 关键词:基因表达谱;Bhattacharyya距离;灵敏度;支持向量机14-折交叉验证方法 中图分类号:TP391文献标识码:A 文章编号:1001-2400(2012)01—0191-06 Methodfor thetumorbasedon extracting gene the vector machine support QIN 2,ZHANG Chuandon91,LJL,SanyangShifan91 of Scienceand (1.School Univ.。xi’an710071.China; Computer Technology.Xidian of 2.SchoolSeience。XidianUniv.,Xi’an710071.China) ofthe Abstract: tothecharacteristicscoloncancer with According geneexpressionprofileshigh and methodis tomeasurethetumor withthe dimension,small noise,a samplegreat proposed gene

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