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U【)C：575……………………………………………………………………………………………………………………………………I
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中文摘要…………………………………………………………………………………………………………V
英文摘要………………………………………………………………………………………………………．vii
第一章绪论……………………………………………………………………………………………………．1
1，1高通量DNA测序技术………………………………………………………………………………．1
1．1．1高通量DNA测序技术的发展现状……………………………………………………………1
1．1．1．1
454生命科学的焦磷酸合成测序技术…………………………………………………1
1．1．1．2
SOLID(SupportedOligoLigation
1．1．1．3
Illumma的循环合成测序………………………………………………………………～3
1．1．1．4滚环扩增纳米阵列与杂交连接测序…………………………………………………一3
1．1．1．5单分子微阵列及单分子测序…………………………………………………………一4
1．1．2高通量测序技术的应用………………………………………………………………………．5
1．1．2．1全基因组测序……………………………………………………………………………．．5
1．1．2．2高通量RNA测序及其在转录组和基因表达调控研究中的应用……………………5
1．1．2．3高通量测序技术在基因组DNA甲基化分析中的应用………………………………5
1．2DNA．蛋白质相互作用的研究方法及发展…………………………………………………………一6
1．2．1
1．2．2凝胶阻滞和免疫凝胶阻滞试验………………………………………………………………．7
1．2．7
ChIP—Seq技术的发展…………………………………………………………………………。10
127．1样品微量化…………………………………………………………………………………10
1．2．7．2结合位点定位的更高精确度…………………………………………………………10
1．2．7．3多个因子共结合的检测………………………………………………………………11
1．27．4染色质之间的相互作用的检测………………………………………………………．11
1．2．7．5
DNA．蛋白质相互作用的个体间差异的研究………………………………………一12
1．2．7．6染色质的动态结合的研究……………………………………………………………12
1．3单细胞基因组测序研究………………………………………………………………………………13
l-3．1单细胞分离方法………………………………………………………………………………13
1．3．2细胞裂解和基因组DNA的提取……………………………………………………………．14
1．3．3单细胞全基因组扩增技术……………………………………………………………………14
1．3．3．5
1．3．4单细胞全基因组检测技术的应用……………………………………………………………16
1．3．4．1癌细胞的演化的研究…………………………………………………………………16
东南大学博士学位论文
1．3．4．2微生物群落的单细胞测序……………………………………………………………16
1．3．5生殖细胞及遗传重组研究……………………………………………………………………17
l，3，5．1以连锁不平衡(LD)为基础的群体遗传重组研
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