拟南芥micrrnas序列特征分析及人工合成amirna-gfp载体构建.pdfVIP

摘要 RNA干扰(aNA 比，miRNA剪切靶基因时允许和靶基冈部分碱基错配，因而基于miRNA特性可以避免因为基因变异 或基因间同源性较高而导致的基因沉默干扰失败。 统计了拟南芥内源miRNA的序列组成特点，以及miRNA与其靶基因配对序列的规律。通过选用拟南芥 mRNA 抑制程度、蛋白降低的程度和amiRNA的剪切位点，研究结果有以下几个方面： 基偏向是C，这是拟南芥内源miRNA碱基序列组成的特点。 2、拟南芥miRNA和靶基冈碱基配对的规律：(1)在254条miRNA中和靶基因完全配对的仅只 有5条，约占1．8％，其中只有1个碱基错配序列有42条，占总数15％；2个碱基错配序列有68条，占总 碱基位来看，miRNA与靶基因的错配碱基常出现在3’和5’末端，在第l和21碱基位碱基错配占总数的 58．3％和43％，其次第2、7、8、13、15、20碱基位碱基错配比率都超过了20％。 定餐结果表明：在GUS．GFP基因mRNA水平，在瞬时转染72d时后，GUS．GFPmRNA的水平被抑制 了50％左右。统计分析， GUS-GFP蛋白水平中GUS蛋白降低了55．6％。为了进一步了解外源 和11碱基位进行切割。 关键词：拟南芥，基因沉默，RNAi，微小RNA，人：T=小RNA Abstract RNA allefficient isanatural interference(RNAi)isgenesilencingtechnology．It processby whichdouble．．strandedRNAdirects of sequence．．specificpost-transcriptionalsilencing callbe smallRNAmoleculessuch鹪siRNAandmiRNA． homologousgenes．RNAitriggeredby and theactionsofsmall miRNAsilences ina manner geneexpressionsequence—specificthrough of smallssRNA RNAs．microRNAs(miRNAs)areendogenously piecessingle-stranded expressed nucleotidein direct of～22 sequences length，whichnaturallygenesilencingthroughcomponents sharedwiththeRNAi maturemiRNAscan mRNA regulategene by pathway．The expression ortranslational withsiRNA．miRNAalso amoree仃icient cleavage repression．Compared plays rolebecauseofthe ofmiRNAin with repression flexibility bindin