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普通小麦及其近种lmw-gs的鉴定、编码基因克隆与进化分析
摘要
小麦贮藏蛋白是影响小麦品质的主要蛋白,主要包括醇溶蛋白和谷蛋白。谷蛋白
HMW-GS与LMW-GS的含量及组成可直接影响小麦面粉的加工品质。本研究以普通
小麦及其近缘种为材料,利用SDS.PAGE技术通过对它们中LMW-GS的分离和鉴定,
设计等位基因特异PCR(AS-PCR)引物,对其编码基因进行分子克隆、序列测定与
分析,预测LMW-GS的二级结构特征,分析贮藏蛋白基因家族的分子进化关系。为
利用基因工程改良小麦品质提供参考依据,为迸一步探讨小麦起源与进化奠定基础。
1。普通小麦及其近缘种中LMW-GS的分离鉴定和基因克隆
在部分品种中存在。
根据LMW-GS编码基因5’和3’端的保守序列,设计了5对特异性引物,分别以
P1355707)的基因组DNA为模板进行扩增,均获得了较明显的扩增条带,然后分别
录GenBank。
2.普通小麦及其近缘种LMW-GS基因的序列特征分析
的特征序列,有TATA框,CAAT框和胚乳框,它们对基因表达有着重要的作用。基
.74,.62到.57两个位置上,二者均有一个CAAT框在.10到.6的位置上。一个胚乳
置上含有序列为AAATAA的多腺苷酸化信号,均分别位于终止密码子下游72到
77,130到136,141到147这三个位置上。
分别由一个终止密码子TGA终止编码,各编码280个、303个氨基酸。根据推导出
的氨基酸序列,计算出成熟蛋白质的分子量,分别为37.8KD、37.7KD、37.4KD、
因此推测这12个基因编码的蛋白质均为c亚基。通过序列特征分析,它们均为
TAA终止编码,编码316个氨基酸。根据推导出的氨基酸序列,计算出成熟蛋白质
的分子量为34.2KD。因此推测这个基因编码的蛋白质为C亚基。通过序列特征分析,
27个Q的寡聚谷氨酰胺链等特征,与小麦加工品质正相关,可能为候选的优质基因。
大小为1074bp,由两个连续1:AA终止密码子终止编码,编码356个氨基酸。根据推
导出的氨基酸序列,计算出成熟蛋白质分子量为38.3KD,因此推测此基因编码的蛋
的编码区内部都有终止密码子,导致了这些基因不能表达,为沉默基因。
3.LMw.GS基因编码蛋白的序列比对
结果表明,每一类型的基因与其同类型的基因具有较大的序列相似性。
63位上多出一个半胱氨酸残基外,其余基因编码的蛋白均具有8个半胱氨酸残基。
我们推测,这个额外半胱氨酸残基的出现,可能增加分子间二硫键数目,使面团粘弹
性增加。因此,我们推测克隆的这2个新基因可能和小麦的优良品质相关。
V
大量的氨基酸的插入或替换。一个长的N.端重复区对小麦面粉的品质也有积极作用。
因此,我们推测克隆的这3个新基因可能和小麦的优良品质相关.
4.LMW.Gs的二级结构预测
AILMW-m2、
本研究采用PSIPRED2.0二级结构预测方法,预测结果显示,
因。
5.LMW二Gs基因的遗传进化关系
进化树分析表明:I型基因明显比另外两种基因分离出来得早,而LMW-s基因
点的分离则大约发生在9.149百万年前。
关键词:小麦,低分子量谷蛋白亚基,SDS.PAGE,分子克隆,分子进化
VI
Abs仃act
The isthe
protein main ofwheat.Itcontains
storage componentaffectingquality
and arethe ofwheat
gliadingtutem,Thegtuteninsmajorcomponents proteins,
storage
whichconsistof and
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