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枇杷小种子植株传多样性的rapd分析
摘 要
oo份枇杷小种子植株个体材料、1份母株材料以及
本研究采用RAPD技术对1
l份母株砧木材料进行变异性和遗传多样性分析。首先对枇杷基因组DNA的提取方
法进行了改良,以获得高质量的基因组DNA,用于RAPD分析。然后对枇杷RAPD
反应体系体系进行优化,建立最佳RAPD扩增体系,筛选出适合枇杷RAPD分析的
随机引物并进行PCR扩增。对样品的RAPD图谱及数据进行统计分析。研究结果如
下:
(1)本试验采用改良CTAB法,成功地从新鲜和硅胶保存的枇杷嫩叶中提取D
脂糖凝胶电泳分析,提取的DNA质量高,完整性好。
buffer
的模板DNA,10xPCR
2.5pL,2.0mmol/LMgCl2,0.2mmol/LdNTP,0.39rno
1.5min,72。C2min,45个循环后在72。C延伸10rain,结束后在4。C条件下保存。
最后用2.O%的琼脂糖凝胶电泳检测其扩增产物。
(3)采用优化后的反应体系对120个引物进行筛选,经过三次重复,筛选出多
态性和扩增重复性好、谱带清晰且较多的9个引物。
(4)利用9个筛选出的RAPD引物对枇杷小种子植株群体、母株及其砧木材料
进行扩增,研究群体的遗传多样性。共产生100条谱带,其中83条为多态性带,占
83%,平均每个引物扩增的DNA带数为11.1l条,多态性带9.22条。根据扩增结果
建立了个体间亲缘关系的UPGMA聚类图,将102份单株划分为5大类。
(5)通过POPGENE32
1.32软件的分析,获得了枇杷小种子植株群体Nei基因
多样度指数和Shannon多样性信息含量指数。枇杷小种子植株群体内遗传多样性较
高,同时,存在大量的变异单株,为枇杷选育种提供了丰富的原材料,为后续研究奠
定了基础。
(6)分析了枇杷小种子植株材料的分子性状,发现多份单株具有各自的特异性
可作为这些单株今后成为新品种或株系的分子指纹标记。
关键词:遗传多样性;RAPD;小种子植株;枇杷
Abstract
Random usedto the di
amplifiedpolymorphicDNA(RAPD)wasstudygenetic
of100 fromthe
miniature maternalmaterialand1 rootst
versity seedlings seeds,1
methodofDNAextractionwasmodifiedfor DNA
ock.Firstly,the loquat extraction
to DNAthatwasused
acquirehighquality forRAPD opt
imal
RAPD wereestablished.Thethat
ampificationsystem weresievedwer
primers
eusedfor DNAPCR
sample andex
amplfication.Finally,RAPDfingerprintmaps
datawerecountedand to moleculecharacteristicof
periment
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