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第四节 图谱分析
Information is tied together with multiplex PCR and data analysis
AmpFlSTR® Identifiler™ (Applied Biosystems)
D8S1179 D21S11 D7S820 CSF1PO
TH01 D13S317
D3S1358 D16S539 D2S1338
D19S433 VWA TPOX D18S51
D5S818
AMEL FGA
1 integrated analysis vs.
16 separate runs
• 在STR分析实践中,不是每批次的每个样本
分析,都能由计算机程序准确自动地完成。
• 有时候样本的自动分型结果是错误的,需
要专业人员调整分析参数,重新分析才能
获得正确的分型。
影响分型的情况
一、分型标准品等位基因命名错误
二、内标识别错误
三、基线跳跃或摆动
四、stutter峰
五、非模板依赖加A
影响分型的情况
六、其他伪峰
七、性别识别图谱异常
八、峰的均衡性
九、杂合性丢失或3等位基因
十、off-ladder峰
一、分型标准品等位基因命名错误
• Ladder中,每个基因座的各个等位基因的量
不是完全相等的。电泳检测后,其信号强
度也不同。
• 1、如果某个基因座的某个等位基因片段:
量相对较少、上样量偏少、峰阈值设置过高
所有等位基因都减少一个重复单位命名
• 1、如果某个基因座第一个等位基因片段:
之前出现小一个重复单位的伪峰(复制滑脱
产物)、上样量偏大、峰阈值设置过低
所有等位基因都增加一个重复单位命名
复制滑动:STR多态性的主要原因
采取的措施
1、同步分析已知对照样本(9947A )
2、核对各基因座Ladder的等位基因命名是否
准确无误。
二、内标识别错误
标识正确的内标
解决
• 1、信号太低 调整峰的阈值
解决
增加内标量重新电泳
• 2、分析范围设置错误
解决
重新调整分析范围
200 300 350 400
340
• 3、电泳数据不全 内标片段未被全部
收集,大片段内标缺失
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