六个家鹅品种n4基因序列进化与群体遗传结构分析.pdfVIP

摘 要 本试验测定了在我国家鹅杂交育种中广泛应用的六个家鹅品种线粒体N)4 基因的部分核苷酸序列(621bp)，发现其平均GC含量为45．8％，偏倚不严重， 在密码子的三个位点上，核苷酸组成的偏倚也不严重，但密码二子的使用存在严重 偏倚；序列间发生转换的碱基对明显大于发生颠换的碱基对(si／sv：3．8)，转换 主要发生在密码子第三位点上，颠换则全部发生在密码子第三位点上；同义替换 明鹅线粒体N04基因在进化过程中经历了净化选择的作用；共检测到了4种单倍 型， 4种单倍型的频率分别为0．467、0．0333、0．467、0．0333，单倍型多样性 为0．582．各品种间的核苷酸分化系数(Nst)在0至1之间，家鹅群体的遗传 分化主要是由灰雁家鹅与鸿雁家鹅品种间的遗传分化造成的；六个家鹅各品种内 核苷酸多样性(Pi)很低，在0至0．01417之间，各品种间的遗传距离(D)很小， 在0至0．02475之间，遗传相似度高(F：0．97525至1)，而且同属于灰雁或鸿 雁的家鹅品种之间的遗传相似度比分属于灰雁、鸿雁的家鹅品种之间的遗传相似 度更高。 关键词： 遗传结构 进化 线粒体 ND4基因 家鹅 刖 舌 进化是生物发育和遗传的源泉，基因进化形成的多态性是生物群体遗传结构多样性的 基础，生物群体独特的遗传结构是基因匠期进化和自然选择的结果(Ben，1999)。动物线粒 体基因组ND4基因进化较快，有良好的种系(Lineage)发生信息，可较好地反映物种的进化 系较近群体的系统发育关系和群体的遗传结构(Michael等，1998)。 据联台国粮农组织对养殖业生产所作的评估，在养殖业生产中．品种的贡献率达到 35％～60％，平均为45％。了解畜禽的遗传结构是充分利_}；}j畜禽遗传资源，制定合理的育种方 案，培育优质高效畜禽品种的基础，也是21世纪畜牧业要解决的三个重大科学问题之～(炅 常信等，2000)。因此，对家鹅进化和遗传结构的分析，将有助于充分认识和合理利用鹅的 遗传资源，为制定科学的育种方案和正确的技术路线，培育高效优质的家鹅品种及家鹅品种 的杂交利用提供基础理论依据。 l文献综述 】．1基因进化与群体遗传结构分析的主要内容和基本方法 基因(核苷酸序列及其编码的蛋白质序列)进化分析是生物分子进化研究的 一个重要方面。它主要是通过对基因序列的分析，了解基因序列的组成，探讨基 因序列的演变规律及进化机制等问题。 群体遗传结构分析的主要内容有：种群的遗传组成(单倍型)：单倍型多样 性及其在各亚群中的分布，种群的遗传多样性及分化程度等。 分析基因进化与群体遗传结构的方法主要有以下几种： 1)表型推断法即通过对蛋白质、核酸分子的总体相似性或通过对表信息 分子的分析来推测遗传变异，从而了解研究对象的起源和分化情况。这是一类通 过由包括蛋白质的血清学、DNA—DNA杂交以及各类小分子化合物的仪器分析方法 data)来估计总体相似性的方法。 等产生的距离数据(distance 2 2)立体结构法蛋白质、核酸等大分子的高级结构是由其低级结构(一级 结构)决定的，但高级结构的进化要比低级结构保守。因此，在某些情况下，通 过高级立体结构数据来分析系统发育可能更可靠。 3)间接测序法通过酶电泳、RAPD、RFLP等方法，测定信启、分子的多态 性，再根据一定的理论假设和统计理论推断遗传变异。这种方法简便快速、花费 少、对样品的要求不高，适合于进行较大规模的比较研究。 4)直接测序法 即直接测定生物体内信息分子(DNA、RNA、蛋白质等)的 序列，通过这些序列产生的性状数据(character data)来分析生物的进化和遗传 变异。由于蛋白质上的氨基酸残基是一个性状，具有20种不同的性状状态，DNA 和RNA上的每个核苷酸位点是一个性状，各有4种不同的性状状态。因此，在研 究生物起源和分化的诸多方法中，直接测序法产生的数据信息量最大，在目前看 来，是最精确的一种方法(黄原，1998)。 基因进化形成的多态性是群体遗传结构多样性的基础，同其它遗