半定量rt-pr和snps技术分析两个鸡品种tcf3基因的表达水平及多态性.pdf

的表达水平及多态性 研究生：卞良勇 导师：王金玉教授 专业： 动物遗传育种与繁殖 (扬州大学动物科学与技术学院 江苏扬州 225009) 摘要 细胞系的转录调节因子，编码一些组织生长和发育的碱性螺旋．环．螺旋(bHLH) 家族的成员，如E12和E47。本次试验以京海黄鸡和苏禽黄鸡两个培育为研究对 象，研究不同组织TCF3相对表达水平，筛选基因序列中的单核苷酸多态性(SNPs) 以及它们与表型性状的相关性。每个品种于16周龄时随机选择30个混合性别的 个体用于实验测定。全血提取基因组DNA，肾、肺和脾组织提取RNA。用分光光 度计和电泳仪分别测定DNA和RNA的纯度和完整性。 的表达水平差异显著(po．05)。两个鸡种中，公鸡的TCF3表达水平相应高于母鸡。 而且在所有表达的组织中都有该趋势，且在肾和肺组织中公母鸡的差异显著 (p0．05)。由此推测TCF3相对表达水平有显著的性别效应。 的SSCP．PCR产物测序发现在139nt处有单核苷酸位点C—T突变。 布，该群体处于哈代温伯格平衡状态。 的基因型相关分析表明：苏禽黄鸡不同组织中AA基因型的表达水平高于AB的表 活体重和TCF3在鸡的肾、肺和脾组织中相对表达水平用最小显著差数法 (LSD)分析其差异显著性，结果表明差异不显著；但是AA基因型个体的相对表 达水平高于AB基因型个体。不考虑基因型差异，在两性中肾和肺的相对表达水平 鸡的相对表达水平高于AB型的公鸡。 不同组织中通过测定mRNA的水平来检测基因表达的差异，并产生一个可测 定的信号用于量化测定，半定量RT-PCR法是检测基因表达微妙差异的一种灵敏方 法，这些差异比RNA装载更能反应表达水平的真实变化。此外，个体特定基因的 的常见类型之间的相关性是判定等位基因和基因相对表达水平之间相关性的一种 可靠的基因分型方法。 关键词：基因表达，半定量RT-PCR，SNPs，TCF3 RT-PCRand to SNPs Assess Semi-quantitative Techniques LevelandMutationofTCF3Genein Expression T’vOChickenBreeds M．S．Candidate：Bian liang-yong Academic Advisor：Pro．／Wangfin-yu ofAnimalScienceand (College Technology，YangZhouUniversity，China) ABSTRACT TheTCF3 factor gene，synonyms(E2A；immunoglobulinenhancer-binding to in cell andcodes E12／E47；ITFI)contributestranscriptionregulationmanylineage fortwo and aremembersofbasic proteins，E12E47，that involvedin and in tissues．Tothe family