广西马流感病毒equineguangxi109(h3n8)的分离鉴定与全基因组序列分析.pdf

分离鉴定与全基因组序列分析 摘要 马流感(Equine 的接触性急性呼吸道传染病，是对养马业和赛马业危害最为严重的传染病 之一，世界动物卫生组织将其列为B类疫病。本研究运用RT．PCR和血清 学方法对从广西4个市采集的马组织样品和马血清进行H3N8亚型马流感 病毒检测，共检测马血清270份，H3N8亚型阳性3份，阳性率为1．1％； 从104份马组织中检出l份阳性，阳性率为O．96％；经鸡胚接种分离到1 株病毒，通过血清学和测序鉴定为H3N8亚型马流感病毒，命名为 编码498个氨基酸，核苷酸同源性为84．7％～99．8％，氨基酸同源性为 93．4％～99．6％；M基因1 027bp，编码252个氨基酸，核苷酸同源性为88．6％～ 酸，核苷酸同源性为69．4％～99．5％，氨基酸同源性为64．7％～99．5％；PA I l基因23 同源性为94．4％～99．3％；PB 12bp，编码757个氨基酸，核苷酸同 源性为92．0％～99．7％，氨基酸同源性为97．1％～99．6％；PB2基因23 12bp， 编码759个氨基酸，核苷酸同源性为92．9％～99．3％，氨基酸同源性为 97．1％～99．6％。广西马流感病毒分离株HA基因8个血凝素糖基化位点相 对保守，未出现增加或者减少现象，核糖体结合位点亦非常保守，HA基因 ORF全长1710 bp，与国内外马流感分离株相比较，在第六位氨基酸后插入 了FIFI四个氨基酸，与哈萨克斯坦在2007年分离到的毒株一致，通过系统 进化树分析，广西觚quine／GuangXi／I／09(H3N8)属于美洲谱系。 关键词：马流感； 序列分析； 全基因； 分离鉴定 Il RESEARCHoNISoLATIoNIDENTIFICATIONAND WHoLEGENOME ANALYSIS SEQUENCE XI oFGUANG INFLUENZAVIRUS EQUINE 刖Equine／GuangXi／I／09(H3N8) ABSTRACT anacuteand Equineinnuenza(EI)ishighlycontacting influenza the diseasecaused horse byequine Virus(EIV)，whichseriouslyendangers it and IntemationalDes haslistedasB raisingracing．Omce Epizooties ImPCRand inhibition 04horsetissue epidemjcs．By hemagglutinationtest(HI)，1 and207horseserums，whichcollected行omfourcitiesin samples