西太平洋暖池核区0ntong-java海台微生物群落结构多样性研究.pdfVIP

摘 要 为了研究西太平洋暖池核心区 Ontong-Java 海台中微生物群落及多样性，本研 究以 PCR 技术为基础，对古菌和细菌分别构建了 6 个不同层位的 16S rDNA 基因克 隆文库。经 PCR 扩增、基因序列测序、序列大于或等于 97％相似度分析以及序列 提交到在线杂合子检测系统以检测其是否为杂合子序列；共得到古菌的有效克隆 561 个，135 种 RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism ，RFLP)带型和 50 个基因操作分类单元（Operational Taxonomic Units ，OTUs ）。共得到细菌的有效克 隆 539 个，91 种 RFLP 带型和 62 个 OTUs 。 通过系统发育树的分析得出，本研究中古菌和细菌的序列与来自各种海洋环境 中的序列有较高的同源性并且绝大多数是不可培养的。古菌均属于泉古菌 （Crenarchaeota ）（45.3％）和广古菌(Euryarchaeota ）（54.7％）。Marine Group II （MG II ）(49.0％)和Marine Group I （MG I ）（45.1％）为古菌的优势类群。细菌 包含了 8 个不同的类群，包括变形菌门（Proteobacteria ）、酸杆菌门 （Acidobacteria ）、 蓝澡门（Cyanobacteria ）、拟杆菌门（Bacterioidetes ）、绿弯菌门（Chloroflexi ）、 疣微菌门（Verrucomicrobia）、浮霉菌门（Planctomycetes ），以及一个未确定的类 群。其中变形菌门包括 Alpha- （α- ）、Gamma- （γ- ）和 Delta- （δ- ）变形菌亚门， 在细菌的研究中 Gamma-变形杆菌亚门为绝对优势类群。 香农威纳指数（H ）、辛普森指数（1/D ）及均匀度（J ）等多样性指标和稀释度 曲线图显示，古菌克隆文库的的 CWP-A 在6个层位中的多样性最高，而细菌 OWP-D 的多样性最高。 对西太平洋暖池核心区 Ontong-Java 海台古菌和细菌中的群落结构进行比较分 析发现，西太平洋暖池核心区 Ontong-Java 海台细菌多样性较高，共获得 8 种细菌 类群，古菌的多样性与细菌相比较低均属于泉古菌域和广古菌域只包含了 4 个类群。 本研究为今后大范围自然海区微生物调查及海洋微生物资源的开发利用提供了一定 的科学依据。 关键词：西太平洋暖池核心区；Ontong-Java 海台；古菌和细菌；16S rDNA 多样性 Study on Microbial Diversity of Community Structure in the Ontong-Java Plateau from western Pacific Warm Pool Abstract To study the diversity and community structure of Ontong-Java plateau from the core area of Western Pacific Warm Pool, six archaeal and bacterial 16S rDNA gene clone libraries were constructed by using a PCR-based cloning approach,respectively 651 archaeal valid clones, 135 Restriction Fragment Length Polymorphism(RFLP)genotypes and 50 Operational Taxonomic Units(OTUs)were identified byusing PCR amplicons, sequencing, chimera-check and 97 ％similarity analysis.Meanwhile,539 bacterial cl