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猪瘟病毒e2基rt-pcr检测方法的建立及病毒分子流行病学研究
摘要
病毒分子流行病学研究
预防兽医学专业:汤波
指导老师:黄伟副教授
王琴研究员
摘 要
Swine swinefever
猪瘟义称经典猪瘟(ClassicalFever,CSF),是由猪瘟病毒(Classical
E2
virus,CSFV)引起猪的高度致死性、接触性传染病。本研究建立了CSFVRT-PCR检测方
法,并采用该方法进行了CSFV在人工感染实验猪体内的组织分布研究,同时对我国部分地
区进行了CSFV分子流行病学研究。
为了建立一种准确灵敏特异的CSFVRT-PCR检测方法,并根据目的产物的序列进行CSFV
的分子流行病学研究,分析CSFV的分子遗传进化趋势。本研究通过比对GenBank公布的34
条国内外已测得的CSFV全长序列、18条牛病毒性腹泻病病毒.I(BvDVI)和6条BVDV-
II基冈组全序列,避开与BVDV同源区域,在CSFV基因组E2区域设计并合成了4对引物,
后对RT-PCR反应体系各成分进行优化,建立了一套CSFVRT-PCR检测方法。采用研制的三
批CSFVRT-PCR试剂,通过对30个质控样品进行特异性、灵敏度、敏感性、稳定性和重复
RNA;重复检出率分别在91.11%.100%;同时采用欧盟猪瘟参考实验室20份标准样品进行符
合性试验,符合率达到90%,表现出高度的一致性。结果显示该方法具有良好的特异性、灵
敏度、敏感性、稳定性和重复性。
为了全面系统的研究猪瘟病毒感染后在猪体内外的病毒分布规律,指导流行病学调查采
样,本研究通过肌肉注射人工感染毒价为4X
头60日龄长白猪急性感染模型,同时设立1头阴性对照。人工感染后每天随机选择两头猪,
腋动脉放血致死,采集各组织器官和体外排泄分泌物共34种,采用上述建立的CSFvImPCR
检测方法对34种急性样品进行CSFV核酸检测,并用抗CSFVE2单抗WH303对其中22种
组织器官进行免疫组化检测抗原;同时进行临床观察、体温测定并给予进行临床计分。RT-PCR
检测结果显示,感染后第一天有7种组织器官CSFV检测为阳性,至第五天34种急性样品全
是各种与免疫相关的淋巴结和淋巴样组织,而肌肉和皮肤检出数最少;4种体外样品(粪、尿、
眼分泌物、鼻拭子)分别在3.5天内检出阳性。免疫组化检测结果显示,22种组织器官切片
中有19种观察到阳性信号,这19个组织器官与CSFVRT-PCR检测结果相符合;而皮肤、肌
肉和喉头的组织切片中未观察到阳性信号。结果表明在CSFV人工急性感染模型中,病毒感
染后能在24小时间内出现病毒血症,持续整个急性感染病程;病毒对血液和与免疫相关的组
织器官表现出更高的亲和性,并且在3.5天内开始出现体外排毒;CSFVRT-PCR和免疫组化
两种方法在急性感染模型的检测中具有较高的符合性,符合率为86.36%。上述研究对CSFV
临床诊断具有重要的指导意义,临床急性感染猪应首先采集血液和免疫器官,其次为空肠、
回肠段等组织器官。但是在对感染猪只进行处理时必须严格控制对感染猪胴体的处理,以防
止疾病扩散。
运用本研究所建立的CSFVRT-PCR对我国18省市644份疑似猪瘟样品进行检测,再将
检测为阳性的样品序列进行分析,以研究国内猪瘟流行态势和地理分布。结果644份疑似样
列同源性均在85.5%一100%之间;73株野毒以“北京、天津、河北——湖北——广东”轴东西
发散式分布在我国中东部地区;研究显示目前无基因3群流行株存在。
本研究成功建立了CSFVRT-PCR检测方法,为CSFV的临床诊断提供了重要的技术支持,
临床应用显示本研究所建立的方法也可以用于CSF流行态势的监测;同时通过对急性感染的
研究得到人工感染模型中病毒的组织分布和排毒规律,为进一步研究CSFV的致病机理增添
了新的数据。
关键词:猪瘟:RT-PCR;免疫组化;分布;遗传进化
II
Abstract
EstablishmentofRT-PCR
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