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家蚕未受精卵表序列标签(est)分析
摘 要
家蚕是丝绸业的生物基础。通过EST测序从分子水平上获得大量数据,可为家
蚕基因组结构和绝大部分基因提供信息,为进一步进行家蚕功能基因的研究奠定基
础。 .
及发育分析等方面具有重大的价值。《i改家蚕肾矗老卵和正常形卵的未受精卵弓/
为材料建立了cDNA文库,这些未受精卵的细胞中含有大量的早期胚胎发育所必需的
信息。
f+
f 母性基因是指这些未受精艘中所含有的大量影响后代发育的一类基因,这些基
因在卵子发生过程中表达,在卵子发生过程或胚胎发育过程中翻译。母性基因在胚胎
的早期发育阶段起着至关重要的作用,主要功能是决定轴的分化、卵裂方式的形成
和形态的发生。在昆虫的早期发育中,胚胎的前后轴和背腹轴分别独立地由母性基
因产物决定。这些母性基因主要编码转录因子或调控蛋白,它们的产物通常形成一
定的浓度梯度并产生特异的位置信息,以进一步激活一系列合子基因的表达。随着
这些基因的表达,胚胎被分成不同的区域。每个区域表达特异性基因的组合,沿前
后轴或背腹轴形成一定的体节模式。未受精卵中的mRNA及蛋白质均属于母性基因产
物。 L一,,,
“
,
t、莩、.歹一专陲验,先将获得的原始数据屏蔽载体序列,然后再去除低质量和小于l。0bp
~
寻找具有相似性的蛋白质和核营酸序列。对只知氨基酸序列但功能未知的基因,运
用SMART软件分析其结构域,从而推测所获得的表达序列标签可能的性质和功能。
另外这些数据还与家蚕EST数据库SILKBASE
rg网址进行基因功能分类。.j一一,
http://www.geneontology.o
。
、
i f|
一
,
厉拼接得到374个非照复序列,其中援犬的由4条EST组成,罐疑的为l958bp。374
条非重熨序列中15条是coBtig,118条si
列,其余24I条是肾照形束受精费文瘁中豹。通过犬援模韵EST测痒和分析,获褥
了大量功能基因的信息。经生物信息学分析发现,171个与融朔基因爨鸯较毒躲相{娃
性(已知基因),25个与已知序列具有较高的相似性(新基因),其余178个为低度
稳镢或揽有相{|;}经豹痔列(未知鏊函)。
来受精舞文库提供了大量韵母性基困靛信惠,夺巨验共获得3个与已知的母性
基因高度相似的EST序列;;分另唾是BmVLG、capu积8nnexinb13。荚余剥点要燕一些
与I)NA复制,熊量代谢,信号传礤以及胚胎发商中个体形成等相关的基因相似的序
列。这些有嗣豹信惠为母性基因功能的研究提供了序列信息,为进一步研究家蚕胚
胎早期发商的调控提供基础数据,同时还对家蠢功能基因缀的獗究具有蕊要搀动痒
肌。每j)一~‘
’ 蛰
关键词:家蚕 表达序列标艇≮EST)4束受糟卵母性基因
~~一~J一一…一
U
ABSTRACT
s abasic
Siikworm(Bombyxmori)i unitofthe
biologic
can
sequence obtaindetailedinformation
concerned
tag)sequencing on
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