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DNA的提取及鉴定 一、动物肝脏中DNA的提取 一 . 实验目的 学习和掌握用浓盐法从动物组织中提取DNA的原理和技术 了解分离提取DNA的一般原理 DNA的主要来源 1.动物组织及器官:脾、肝、胸腺、鱼类精子等。 2.植物:种子的胚芽等 3.微生物:细菌、酵母菌等 核酸和蛋白质在生物体中以核蛋白的形式存在,其中DNA主要存在于细胞核中,RNA主要存在于核仁及细胞质中。 核酸提取的主要步骤: 1.破碎细胞:研磨、组织匀浆、超声波、冻融;一硫氰酸胍、碱裂解;酶解(溶菌酶) 2.除去与核酸结合的蛋白质以及多糖、脂类等生物大分子:酚/氯仿抽提、蛋白质变性(SDS、异硫氰酸胍等)、蛋白酶处理、高盐洗涤 3.除去其他不需要的核酸分子 4.沉淀核酸,去除盐类,有机溶剂等杂质 生物体组织细胞中的脱氧核糖核酸(DNA)和核糖核酸(RNA),大部分与蛋白质结合,以核蛋白——脱氧核糖核蛋白(DNP)和核糖核蛋白(RNP)的形式存在,这两种复合物在不同的电解质溶液中的溶解度有较大差异。在低浓度的NaCl溶液中,DNP的溶解度随NaCl浓度的增加而逐渐降低,当NaCl浓度达到0.14mol/L时,DNP的溶解度约为纯水中溶解度的1%(几乎不溶);但当NaCl浓度继续升高时,DNP的溶解度又逐渐增大,当NaCl浓度增至0.5mol/L时,DNP的溶解度约等于纯水中的溶解度,当NaCl浓度继续增至1.0mol/L时,DNP的溶解度约为纯水中溶解度的2倍(溶解度很大)。而RNP则不一样,它在浓NaCl溶液和稀NaCl溶液中的溶解度都很大。因此,可以利用不同浓度的NaCl溶液将DNP和RNP分别抽提出来。 二 .实验原理 将抽提得到的DNP用十二烷基硫酸钠(SDS)处理,DNA即与蛋白质分开,可用氯仿-异丙醇将蛋白质沉淀除去,而DNA溶于溶液中,加入适量的乙醇,DNA即析出,进一步脱水干燥,即得白色纤维状的DNA粗制品。 为了防止DNA(或RNA)酶解,提取时加入乙二胺四乙酸 (EDTA)。大部分多糖在用乙醇或异丙醇分级沉淀时即可除去。 DNA中的2-脱氧核糖在酸性环境中与二苯胺试剂一起加热产生蓝色反应。 动植物的DNA核蛋白能溶于水及高浓度的盐溶液,但在0.14mol/l的盐溶液中溶解度很低,而RNA核蛋白则溶于0.14mol/l盐溶液,可利用不同浓度的氯化钠溶液,将脱氧核糖核蛋白和核糖核蛋白从样品中分别抽提出来。在核酸分子中,由于磷酸基的存在,使其酸性占优势, DNA或RNA都能溶于水中,而不溶于有机溶剂。用络合剂EDTA抑制核酸水解酶的活力, 同时用去污剂SDS把蛋白质和DNA分开,再用氯仿-异丙醇作为蛋白质的变性剂沉淀蛋白质, 最后用乙醇把DNA沉淀出来。 三、提取DNA的注意事项 1.避免过酸、过碱及高温 2.加入DNA酶抑制剂:柠檬酸、氰化物、砷酸盐、EDTA、SDS、苯酚等 3.蛋白变性剂反映不宜过于剧烈,以防机械张力使核酸链破坏。 4.加入RNA降解酶除RNA 5.操作迅速 四、实验器材 1. 捣碎机 2. 离心机 3. 手术剪 4. 离心管 5. 刻度吸管 6. 烧杯(100ml,250ml) 7. 玻棒 8. 新鲜动物肝脏 9.石英比色皿 10.量筒(10ml,100ml) 11.容量瓶(50ml) 五、 实验试剂 1、0.1mol/LNaCl-0.05mol/L柠檬酸钠溶液(pH6.8)。 2、0.015mol/LNaCl-0.0015mol/L柠檬酸三钠溶液:氯化钠0.828克及柠檬酸三钠0.341克溶于蒸馏水,稀释至1000ml。 3、95%乙醇(A.R.)。 4、NaCl固体(A.R.)。 5、5%SDS溶液:5gSDS溶于100ml水中。 6、氯仿(A.R.)。 7、V(氯仿):V(异戊醇)混合液20:1 六、实验操作 1)粗提 1.称取猪肝8g于100ml的小烧杯中,用剪刀剪碎,加入2倍重的0.1mol/LNaCl-0.05mol/L柠檬酸钠缓冲液(16ml),高速匀浆。 2.将匀浆液(~25ml)转移到100ml离心管中,在4000r/min下离心10min,弃去上清液。沉淀中继续加入25ml缓冲液,搅拌均匀后于4000r/min离心20min,取沉淀。 2)分离DNP、除蛋白 3.将上述沉淀转移至250ml烧杯中,加入40ml0.1mol/LNaCl-0.05mol/L柠檬酸钠缓冲液、21ml氯仿/异戊醇、4ml5%SDS,用保鲜膜封口,振摇30min。 4.缓慢加入3.
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