瓜类细菌性果斑菌种内遗传多样性的研究.pdfVIP

摘要 瓜类细菌性果斑病是发生在葫芦科作物上的一种严重的世界性病害，其病原为西瓜嗜酸菌 (Acidovoraxcitrulli)。该病可侵染多种葫芦科作物并在世界多国和我国多个省份发生，给当地的西 甜瓜种植业造成了严重的经济损失。 瓜类细菌性果斑病菌存在丰富的遗传多样性，为抗病品种的筛选增加了困难，本论文用脉冲 FieldGel 场凝胶电泳(Pulsed SequenceTyping． MLST)两种方法研究了118株国内外瓜类果斑病菌的种内遗传多样性，主要获得以下结论： (1)PFGE多态性电泳图谱表明118株菌共呈现出19条条带，大小在200--2000kb之间，所 有菌株归结为9种条带类型。Ntsys2．1分析，所有菌株分为两个亚群，亚群1有73个菌株，其 中67株分离自甜瓜；亚群2有45个菌株，其中42株分离自西瓜。即亚群l主要是分离自甜瓜 的菌株，亚群2主要是分离自西瓜的菌株，表明果斑病菌在寄主上存在明显的遗传分化。112株 中国菌株中，7l株属于亚群l，其中“株是我国内蒙古和新疆的菌株；4l株属于亚群2，包括 我国多个省份的菌株，没有形成优势地理来源。美国的典型菌株Fc247和美国菌株Fc520归属于 亚群l，其他4株国外菌株都归属于亚群2。PFGE分型技术结果容易判断、重复性好，独具对大 片段DNA分子的分型能力，结果较准确。 表明l V3分析，所有菌株分成了 18个菌株共形成73个序列型(sequencetype，ST)，程序eBURST 3个群：亚群l(groupI)、亚群2(group 个菌株；亚群2包括19个ST，共35个菌株。从寄主来看，亚群l的82个菌株中有甜瓜菌株68 株、西瓜菌株14株；亚群2的35个菌株中有甜瓜菌株2株、西瓜菌株33株；美国的西瓜菌株 菌株，亚群2主要是分离自西瓜的菌株。不同的是，北京的10个西瓜菌株分在了亚群l，可能说 明这lO个菌株与甜瓜菌株的亲缘关系较近。从地理来源看，亚群l的核心型ST45包括3个菌株， 都来自我国新疆，推测亚群1的其他菌株与新疆的菌株关系更密切。亚群2的核心型ST5包括 11个菌株，来自我国北京、新疆、海南、黑龙江和台湾，可见亚群2的菌株在我国的地理分布较 http：／／www．mlst．net／，方便后续研究，该方法分辨率高，为该病害的流行学研究提供了重要数据。 关键词：瓜类细菌性果斑病菌，脉冲场凝胶电泳，多位点序列分型，遗传多样性 Abstract Bacterialfruitblotchofmelons．causedAcidovorax a that citrulli,is disease by world—spared causesserious onthe ofcucurbitsworldwide． damagesplants Duetothe of isdifficulttoselectresistant greatgeneticdiversityA．citrulli，it cultivar．Here，we the ofll8A．citrullistrainscollectedinChinaandabroad analysisedgeneticdiversity withthemethod of field well asmultiloeus results electrophoresis(PFGE)assequence pulsedgel