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黄瓜根结线虫取位点早期形成相关wrky基因的分离与分析
摘要
WRKY蛋白是一类在植物中具有重要作用的转录调控因子,其成员参与了植物的生长、
发育、代谢,以及对生物或非生物胁迫应答的反应。为了确定与黄瓜根结线虫取食位点形成相关
的的WRKY基因的种类及表达特性,根据黄瓜全基因组序列信息,利用生物信息学软件预测,我
个与黄瓜根结发育相关的WRKY基因。主要研究结果如下:
形成过程中可能存在的黄瓜WRKY基因,在黄瓜基冈组中共发现了57个CsWRKY基冈。
2.为了确定与黄瓜根结线虫取食位点早期形成相关的WRKY基因及表达特性,根据黄瓜9930
个WRKY基因可能参与了根结线虫取食位点早期形成及根的生长发育调控。
3.生物信息学分析表明,24个基因被分别定位于黄瓜的7条染色体上。系统进化树分析表明,
二家族。24个基因是对线虫的刺激反应较强烈的基因,即使在同一族中,或者亚族中,WRKY
基冈的表达模式有一定的差异,这可能是家族基因进化过程中功能分化所导致的结果。
因表达则呈现显著的变化,其中8个基冈表现为上调表达(owR翩18、妇、弭、38、42,
的上调表达筹异量最高,在12h时表达量是0h对照的16倍。研究证实黄瓜根结线虫取食位
点早期形成是多个WRKY基冈的复杂调控体系。
关键词:黄瓜,WRKY转录因子,根结线虫,克隆,荧光定量qPCR
Abstract
and
WRKY themost rolein areinvolvedinmetabolic
play importantplant.Notonlythey
proteins
alsoinabiotic andbiotic.1norderto functionsof
stress study
developmentalprocesses,but responses
it.Its
WRKYin antluuln wereclonedfrom aminoacids
L.,24
genesCapsicum WR朋genes sequence,
numberin were initialbio—informationmethod.Mainresultsare
initiallypredictedby got
copy genome
asfollows:
1. Basedoncucumber CsWRKY the interaction
sequence,57 genesduringincompatible
genome
betweenCucumissativssL.and were initial
Meloidogyneincognitainitiallypredictedby
bio.informationmethod.
of sativss
2.Basedonthe Cucumis RT-PCR,24
sequence L.,using D懈科genes
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