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黄瓜抗黑星病基ccu的精细定位与图位克隆及黄瓜与黑星菌互作的表达谱分析
摘 要
黄瓜黑星病是黄瓜的主要病害之一,针对黄瓜抗黑星病基因的研究对明确黄瓜抗病机制和抗
病育种都具有重要的意义。
本研究以高感黑星病黄瓜材料9930(中国华北保护地栽培品种)、高抗黑星病材料91lOgt(欧
site
平NBS.encoding(Nucleotidebandingencoding)基因进行分析,对黄瓜抗黑星病基因进行遗
传、定位和克隆研究,并对黄瓜与黑星病菌的亲和与不亲和互作进行研究,获得如下研究成果:
60个,在基因组上的密度为20个/100Mb基因组,为拟南芥、水稻、杨树等平均密度的l/5,且
现象,LRR区域则高度保守。通过手工注释的方法发现三个黄瓜基因组中7个直系同源基因发生
了移码突变、1个基因发生提前终止密码子突变、1个基因缺失突变,说明不同黄瓜品种中抗病
基因差异大。
2、精细定位了黄瓜抗黑星病基因Ccu,发现Ccu区域存在一个紧密连锁的抗病基因簇。利
技术将Ccu定位到黄瓜2号染色体短臂末端一个长度为140kb的DNA区域,此区域包含一个紧
Csa006758)。通过比较基因组学发现该抗病簇与甜瓜、拟南芥、杨树等同源区域具有共线性(图
4-6、4.7),表明此同源抗病基因簇由一个古老的抗病区域进化而来。
BAC文库,筛选出包含
3、图位克隆了Ccu候选基因。通过构建黄瓜抗黑星病品种91lOgt
kb的亚克隆文库,筛选出包
目的抗病簇的BAC克隆H77.J7和H74.DI,进一步构建了长度为1l
含候选基因起始密码子上游到终止密码子下游各约2.5
Csa006757.1、Csa006758.1,可用于后续转基因验证其功能。
4、通过黄瓜与黑星菌亲和与不亲和互作的表达谱分析,揭示了黄瓜抗黑星病的机制。以黄
瓜高抗黑星病品种Gyl4和高感黑星病品种9930为试材,利用高通量的测序技术对接种病菌材料
及其对照材料进行表达谱分析,发现抗病品种在接种24小时后已全面上调了细胞内的2条HR
Reaction)反应程序和l条PR(Pathogenesisrelated)基因相关的增强防御程序(图
(Hypersensitive
5.1l、表5.5)中的编码关键因子基因。与抗病材料相比,感病材料中只部分启动了第三条WRKY
转录因子参与的PR基因防御程序,其中WRKY转录因子表达水平显著上调,但其下游的PR基
因却没有上调表达,植物未进入对病害的防御状态(图5.11、表5.5)。
综上所述,本研究精细定位了黄瓜抗黑星病基因Ccu,并图位克隆了Ccu的候选基因,为黄
瓜抗黑星病分子育种奠定了基础;表达谱分析明确了黄瓜抗黑星病的抗病机制,为黄瓜抗病研究
提供了参考模式。
关键词:黄瓜,黑星病,黄瓜抗黑星病基因,精细定位,图位克隆
Abstract
ofcucumber itis forUS
a disease
Scab,is worldwide,andmeaningful
veryimportant
tofurtherofthisdisease.
study
Cucumber inthe
of‘‘9930’’,‘‘91
types 109t’’,‘‘Gyl4’’,‘Hardwickii’wereemployed
isaNorthernchinafreshmarketthatis to 11
scab,9
present type susceptib
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