水稻ssr分子谱的构建和四种不同qtl作图方法的比较.pdfVIP

摘要 水稻是世界最重要的栽培粮食作物，养活了世界近一半的人口。水稻的大多 数性状如产量、品质、抗逆性等多为数量性状，因此对数量性状基因位点(QTL) 进行鉴定在水稻遗传育种上具有重要意义。遗传图谱和数量性状的作图方法是进 行QTL定位的基础，因此遗传图谱的准确性和采用哪种作图方法进行QTL定位则 是影响定位位点准确度的二个重要因素。 日本晴序列图的异同。应用目前常用的区间作图法(IM)、复合区间作图法(CIM)、 株高性状进行了QTL作图比较分析。其主要结果如下： 80个单株为作图群体，选用515对SSR引物 1、以(培矮64s／日本晴)F21 在培矮64s和13本晴间进行多态性检测，有l55对引物在双亲间表现明显多态性， 以此构建了包含137个SSR标记的水稻连锁遗传图谱，该图谱覆盖基因组 2046．2cM，标记问平均距离17．1cM。 定位于相同的染色体上，绝大多数标记在2张图谱上的线性排列顺序相同。进一 步与日本晴基因组序列进行比较，I37个标记中有113个标记能确定在基因组序 列图上，有111个SSR标记所在的染色体编号与序列图染色体编号相同，所覆盖 的物理距离为289．7Mb，标记问平均物理距离为2610．0Kb。 3、绝大多数SSR标记在遗传图谱和序列图谱上的线性排列顺序相同，其中 第1、2、3、8染色体上的标记线性排列顺序与序列图谱上的线性排列顺序完全 相同。 4、应用区间作图法(1M)、复合区间作图法(CIM)、基于混合线性模型的复合 晴)F2群体株高性状进行了QTL作图分析。结果如F： 距离也基本…致。 方法估计的QTL的平均加性效应a和显性效应d无显著性差异，同一QTL在显 性效应的方向上表现一致。 (3)建议使用多种作图方法共同作图，并优先标定共同发现的QTL。 关键词：水稻SSR标记连锁遗传图0TL作图方法 Abstract Riceisthemost forhuman food importantcrop consumption，providingstaple formorethanhalftheworld’S ofricetraitsare for population．Most quantitative andstress are controlled exampleyield，quality resistent，which bypolygene．It’Svery for rice to trait importantbreedingimprovementmapquantitativeloci(QTLs)．The andthemethodof arethe basefor the geneticmap QTLmapping QTL mapping．So method andthe aretwo factorsfor ofQTL mappingveracityofgeneficmap important the veracityofQTLmapping． 180 descendants UsingPA64S×NipponbareF2 asmappingpopulation，