水稻转录因子同克隆及籼粳基因组分化的动力学初探.pdfVIP

中文摘要 水稻基因组测序工作完成及大量全氏cDNA序列发表以来．基因注解、基因功能的验证以及 籼粳基因组与重要功能基因的比较，已成为水稻基因组研究的重点和难点。本研究利用日本晴(粳 稻)和9311(籼稻)基因组测序结果，进行转录因子基因的克隆及功能验证。并以丝／苏氨酸蛋 白激酶基因和具有转座活性的mPing转座子来研究水稻籼粳基因组差异，获得结果如下： 分子结构分析、同源序列比对以及表达模式研究结果表明，该基因含有典型的bHLH结构，与 转OsGAI基因植株27个。并发现转基因植株的株高与对照相比明显变矮。 2．发现一个MYB基因存在可变剪接现象．并克隆了其三种不同的剪接产物。 与日本晴之间存在差异，选择其中30个碱基缺失明显的基因用PCR进行验证，有6个基因被 确定存在差异，推测93lI和E1本晴之间约有12个丝／苏氨酸蛋白激酶基因存在差异，占全部 丝／苏氨酸蛋白激酶基因数的9％，远高于9311和日本晴间全基因组的差异(2％)，表明丝／苏 氨酸蛋白激酶基因可能是籼粳基因组分化的热点之～。 4．比较了可移动转座子mPing在9311和日本晴基因组之间的差异．发现在日本晴基因组中 1与日本晴之 均存在，而在粳稻品种中均没有．表明mPing转座子的这种差异不仅表现在931 间，而且表现在其他籼粳品种之间。 行检测，在这些位点上均没有检测到转座子插入，这些mPing转座子插入可能是在野生稻驯 化成栽培稻之后发生的．我们认为转座子的移动和插入可能是籼粳基因组分化的动力之一。 记位于染色体的单倍型区，单倍型区是一组不发生同源重组的基因或DNA序列，这表明籼粳 分化在染色体上并非均匀发生。而且在某中程度上解释了同工酶基因的非随机组合现象形成 的分子机理。 关键词：水稻．mPing转座子，丝，苏氨酸蛋自激酶，转录因子，基因组分化 Abstract The functionidentificationandthe and ganeannotation，gene offunctional comparision genes the havebecome focusofthe on the indica-japonica important functionalsince ganome study ganome rice been genome sequencinghavecompleted．Accordingtothesequencesin and factorswereclonedand the Nipponbam(japonica)，thetranscription identified，andcompared aminoacid differenceof andSer,qhr kinase 11 betweenand roPing protein genes 93 Nipponbare as arefollows： results genomesequence．The 1．AnOsMYC O