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最新第八章基因工程技术.ppt
第八章 基因工程技术 ◆基因工程相关概念 ◆基因工程相关的酶学 ◆基因工程的载体 ◆目的基因的制备和分离方法 ◆载体与目的基因的连接 ◆重组体的鉴定与分析 ◆隆基因的表达 一、基因工程技术相关概念 (一)DNA克隆 克隆(clone): 来自同一始祖的相同副本或拷贝的集合。 克隆化(cloning): 获取同一拷贝的过程,即无性繁殖。 分子克隆(DNA克隆) 细胞克隆 个体克隆(动物或植物) 基因工程: 实现基因克隆所采用的方法及相关 的工作,又称为重组DNA技术 (recom-binant DNA technology)。 基因工程的基本过程和工作原理 在这个过程中: 1.“基因剪刀” 剪取DNA的酶就像一把“基因剪刀” 2.“缝纫针” 连接不同来源DNA分子的酶就像一根“缝纫针”,使二者连在一起 3.“交通工具” 使用载体好比一辆车子 4.“乘客” 有用基因如IL2好比使乘客,车子把乘客送进理想天堂(宿主细胞)去繁衍生息,春华秋实,生产我们需要的产品或开展基因治疗(IL2/LAK→抗癌)。 (二)工具酶 限制性核酸内切酶 DNA聚合酶I 逆转录酶 DNA连接酶 碱性磷酸酶 末端转移酶 Taq DNA聚合酶 工具酶 一、 限制性核酸内切酶1.1 概念 识别DNA的特异序列,并在识别位点或其周围切 割双链DNA的一类内切酶。 是细菌内存在的保护性酶。分为I、II、III三类。II类酶识别序列特点为回文结构。 1. 限制性核酸内切酶 1.3基本特征: 限制性核酸内切酶识别序列长度为4~8个bp。 限制性核酸内切酶作用后产生两种末端: 平头末端(flush end)和 粘性末端(sticky end) 粘性末端 限制性核酸内切酶 限制性核酸内切酶 限制性核酸内切酶 同裂酶(isoschizomer ),是来源于不同物种但能识别相同DNA序列的限制性内切酶,切割位点可以相同也可以不同。 同尾酶(isocaudarner),一类识别不同核苷酸序列但能切割产生相同末端的限制性内切酶,一般是指能产生相同粘性末端的限制酶。同尾酶产生的相同粘性末端称配伍末端(compatible end),可用连接酶连接。如Sal I 与Xho I,BamH I与Bgl II。 限制性核酸内切酶 (1)消化作用:限制性内切酶以同源二聚体的形式与靶DNA序列发生作用识别,靶DNA的大小决定产生特定DNA片段的大小。 (2)片段化:单酶切:n(环状)或n+1(线性) 限制性核酸内切酶 双酶切:a+b(环状),a+b+1(线性) (1)对盐浓度要求相同的酶,原则上可以同时酶切,但应注意:酶切位点太靠近时,先用一种酶切,然后再用另一种酶切 限制性核酸内切酶 (1)不同的DNA片段通过互补的粘性末端连接称为 分子间连接。 (2)同一片段的2个互补末端之间的连接称为 分子内连接 限制性核酸内切酶 (1) DNA样品的纯度: 蛋白质、苯酚、氯仿、乙醇、EDTA、 SDS、NaCl等。 加大酶的用量,1μg DNA 用10U酶 加大反应总体积 延长反应时间 限制性核酸内切酶 (2) DNA样品的甲基化程度:基因工程常常使用丢失了甲基化酶的大肠杆菌来制备质粒 大肠杆菌的dam甲基化酶在5‘GATC3’序列中的腺嘌呤N6 位引入甲基,受其影响的酶有BclI、MboI等,但BamH I、 Bgl II、Sau3A I不受影响。 大肠杆菌的dcm甲基化酶在5’ CCAGG 3’或5’ CCTGG 3’序 列中的胞嘧啶C5位上引入甲基,受其影响的酶有EcoR II等 哺乳动物的甲基化酶在5’ CG 3’序列中的C5位上引入甲基。 限制性核酸内切酶 (3)底物DNA分子的构型:底物DNA不同构型对核酸限制性内切酶活性有较大的影响。 (4) 反应的温度:大多数为37℃ 限制性核酸内切酶 (5)反应体系的组成: 缓冲液的种类,pH值,高浓度的酶、高浓度的甘油、低离子强度、添加二巯基丙醇,二二硫苏糖醇(DTT),BSA DMSO等,会使一些核酸内切酶的识别和切割序列发生低特异性,即所谓的Star activity现象。 EcoR I在正常
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