猪sim1、parγ2和ucp3基因分子特性及遗传效应研究.pdf

浙江大学博士论文 摘要 摘 要 SIMl基因全长cDNA序列，得到3714 bp bp的eDNA序列。其中包括一个2301 的开放阅读框，461 bp的5’非翻译区和952bp的3’非翻译区。利用生物信息学 软件对SIMl基因序列、编码蛋白结构、功能等特征进行分析和预测。结果表明， 猪SIMl全长cDNA序列与牛、人、黑猩猩、猕猴的同源性分别达到92．8％，94．5％， 域在进化中高度保守。pSIMl起源上和牛具有较近的亲缘关系。 应用real-time 育表达规律。结果表明，SIMl基因在检测的十个组织内均有表达，其中在肾脏 表达量最高，肌肉次之，脂肪组织的表达量最低。在金华猪和大约克脂肪组织不 后表达量下降，但不同日龄之间表达量差异不显著。SIMl基因在大约克所有生 长阶段的脂肪组织内表达量均高于金华猪。 应用Westernblot技术研究SIMl蛋白的组织表达谱和在肌肉组织的发育表 达规律。结果表明，SIMI蛋白在7个待检组织内都检测到。其中大脑和下丘脑 的表达量最高，在皮脂内的表达最低，表达模式和mRNA水平检测相似。在金 华猪不同生长阶段的肌肉组织内的发育表达研究发现，SIMl蛋白仅在20d和45d 有微量表达，之后的阶段几乎没有表达。在大约克猪肌肉组织内进行相同实验， 结果表明，SIMl蛋白在大约克不同生长阶段均有表达，在90d和120d表达量最 高，150d后表达量逐渐减少。金华猪的背膘厚和肌内脂肪含量显著高于大约克， 推测SIMl的表达量和脂肪性状值呈现负相关，而且SIMl可能通过参与 术，分析两处多态位点在国内外猪种的分布，结果表明在C534T位点，国内猪 种的C等位基因频率高于国外猪种，在T1677C位点，只有TT基因型存在于外 国猪种内。在PJF2代群体内进行遗传效应分析，发现C534T突变位点基因型与 后腿肌肉重显著相关(pO．05)。等位基因T可显著降低肌内脂肪含量，同时提 高后腿肌肉重和LEA。 浙江大学博士论文 摘要 点。在8个国内外猪种内分析SNPs的多态性分布，发现在A175G位点，A等 位点，只在金华猪内发现等位基因A的存在，其他品种内均只有GG型，推测 状态，利用单倍型方法分析基因对脂肪性状的遗传效应，结果表明，PPAR72基 单倍型个体最高，H2H3次之。由此可知，PPART2基因是猪背膘厚脂肪性状候 选基因。 1C 现在T221C位点，所有国内品种内只发现CC基因型，等位基因T存在于国外 猪种内。A448G位点，等位基因G在除皮特兰猪外的所有猪种内都有较高的频 率。嵊县花猪在这两个位点都纯合，在T221C突变位点为CC基因型，在A448G 突变位点为GG基因型。在PJF2代资源群体内的遗传效应研究发现，T221C位 极显著相关(p0．01)。基因型和后腿pH值相关性也接近显著，GG基因型个 有利于猪脂肪性状的改良。 关键词：克隆，基因表达，单核苷酸多态，相关性分析 U 浙江大学博士论文 Abstract Abstract chose as cDNA Inthis cDNA study,wehypothalamustemplate，thefull—length of SIMl WaScloned．The3720 SIMlcDNA sequenceporcine gene bpporcine