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黄瓜单性结实性状的QTL定位.pdfVIP

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中国农业科学 2015,48(1):112-119 Scientia Agricultura Sinica doi: 10.3864/j.issn.0578-1752.2015.01.11 黄瓜单性结实性状的QTL定位 1,2 1 1 1 1 1 1 武 喆 ,李 蕾 ,张 婷 ,张停林 ,李 季 ,娄群峰 ,陈劲枫 1 2 (南京农业大学园艺学院/作物遗传与种质创新国家重点实验室,南京 210095 ; 山西农业大学园艺学院,山西太谷 030801 ) 摘要:【目的】黄瓜是世界十大蔬菜之一,单性结实是与黄瓜产量和品质密切相关的重要性状。对黄瓜单性 结实进行研究,探明全雌性单性结实性状的遗传规律,并进行 QTL 定位,为进一步了解其分子机理和标记辅助育 种奠定基础,也为黄瓜单性结实性状改良提供理论依据。【方法】试验采用对单株主、侧蔓各夹8 朵雌花,待所有 单株夹花结束后8—10 d一次性调查单性结实座瓜的方法,通过计算单性结实百分率(单性结实瓜数/所夹雌花数 ×100%)来评价单性结实能力。利用全雌单性结实材料 EC1 和雌雄同株非单性结实材料 8419、14519 分别构建的 F 群体进行遗传分析。以 EC1×8419 杂交得到的部分 F 为作图群体,利用 9930 和 gy14 黄瓜全基因组测序开发的 2 2 1 335对SSR标记和双亲重测序开发的143 对Indel标记引物进行多态引物筛选,采用JionMap4.0 软件进行遗传 图谱构建,以该配组 F2 ﹕3 家系群体为研究对象,利用 WinQTLcart2.5 软件进行单性结实 QTL 检测。运用生物信息 学的分析方法对初定位主效QTL区间进行候选基因分析。【结果】试材EC1的单性结实遗传符合数量性状的特征, 但与不同材料配组的后代群体分离偏向不同亲本。构建了一张含有 7 条染色体、116 个 SSR 标记和 9 个 Indel 标 记的连锁图谱,图谱总长度为802.9 cM,标记间平均距离6.3 cM。共检测到7个与单性结实相关的QTL,分别为 Parth1、Parth2-1、Parth2-2、Parth3-1、Parth3-2、Parth5、Parth7,分布在 1、2、3、5、7 染色体上。其中 仅 Parth2-1 在春、秋两季中均被检测到,LOD 值分别为 9.0 和 6.2,贡献率为 17.4%和 10.2%,位于标记 SSR00684-SSR22083之间,认为是控制单性结实的主效QTL位点。该区段的遗传距离为17.1 cM,物理距离2.9 Mb, 包含 307 个基因,推测参与植物激素信号转导的基因 Csa2M035330.1 和 Csa2M070880.1 是与单性结实相关性较大 的候选基因。其他位点都为微效位点。【结论】单性结实的遗传符合数量性状特征,位于2号染色体上的Parth2-1 是控制黄瓜单性结实性状的主效 QTL 位点。推测植物激素代谢通路中的基因是可能的候选基因。研究结果为单性 结实主效基因的精细定位和克隆及分子标记辅助育种奠定了基础。 关键词:黄瓜;单性结实;连锁图谱;QTL定位 QTL Mapping for Parthenocarpy in Cucumber 1,2 1 1 1 1 1 1 WU Zhe , LI Lei , ZHANG Ting ,

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