鸡传染性支气管炎病毒中国分离株LH2_01_10纤突蛋白基因的遗传变异.pdfVIP

中国农业科学 2004,37(2)0306-312 ScientiaABriculturaSinica 鸡传染性支气管炎病毒中国分离株LH2/01/10 纤突蛋白基因的遗传变异 刘胜旺’，刘玉芬’，孔宪刚’，刘宝全2 (’中国农业科学院哈尔滨兽医研究所/兽医生物技术国家重点实验室，哈尔滨 150001 东北农业大学动物医学院，哈尔滨 150030) 摘要:对传染性支气管炎病毒LH2/01/1。的S1和S2基因分别进行RT-PCR扩增、克隆和序列测定 结果表明，其 S墓因由3495个核普酸组成，编码的多肤由1164个氮墓酸残墓组成。S蛋白的切割识别位点氨墓酸组成为组氨酸- 精氨酸一精氨酸一精氨酸一精氨酸 (HRRRR)推测其裂解后形成的S1和S2亚单位中，S1由539个氮墓酸残墓组成， S2由625个氮墓酸残墓组成 序列分析发现:LH2/01/10与Beau,M41,CU-T2,D1466,DE072,Holte,Gray,Ark99 Co- H52,KB8523,SD/97/02,ZJ971和LX4毒株S基因推导的氨墓酸同源性在63%一96%之间。其中与国内分离毒株 SD/97/02和LX4氨墓酸的同源性均在，5%以上，三者切割识别位点也相同 但与另一国内分离株ZJ971氨墓酸的同源性 仅为75%，而与国外毒株之问在83%以下.切割识别位点也与ZJ971和所选的国外参考毒株代表性的RRF/SRR位点不同。 与这些参考毒株相比，LH2/O1/10S墓因在76-78位缺失TCT碱基，在67-69位插入TCT碱基，105位和549位氛的墓 酸发生点突变 总体来看，SD/97/02的S1基因推导的氨基酸序列与国内外已报道的42株参考毒株同源性较低，在52%- 96%之间 与国内分离毒株亲缘关系相对较近，其中与国内近年来不同地区分离的A2,LX4,SD/97/02,TJ/96/02,JX/ 99101,SAIBWJ和Z等毒株在进化树分析中属于同一亚群，氮墓酸同源性也在a伟以上.与形”等疫苗株的氮墓酸同源 性在75%以下，同源性较低。在Si墓因编码蛋白的3个高变区和6个抗原表位内，1.112/01/10与该亚群内的致肾脏病变 型毒株同源性均较高.由此可见，LH2/01/10与国内分离的毒株具有较近的亲缘关系，与疫苗株11120S1墓因的低同源 性以及1,112/01/10S墓因本身的缺失、擂入和点突变造成的变异可能是导致该毒株在1BV11120疫苗免疫鸡群中致病的 主要原因 关键词 传染性支气管炎病毒;纤突蛋白墓因;遗传变异 58;1 八 GeneticVariationofSpikeGeneofInfectiousBronchitisVirus LH2I01I10IsolatedinChina LIUSheng-wang,LIUYu-fen2,KONGXian-gang,LIUBao-quan2 (NationalKeyLaboratoryofVeterinaryBiotechnology/HarbinVeterinaryResearchInstitute,Chi，二A‘cademyofAgriculturalSciences, Harbin150001;.4nimalMedicineCallogeofNortheastAgriculturalUniversity,HarbinIS0030) Abstract:AccordingtothepublishedSgenesequenceofIBV,twopatesofspecificprimersweredesignedandsynthesized.