生姜种质遗传多样性和亲缘关系的SRAP分析.pdfVIP

中国农业科学 2014,47(4):718-726 Scientia Agricultura Sinica doi: 10.3864/j.issn.0578-1752.2014.04.012 生姜种质遗传多样性和亲缘关系的SRAP 分析 李 秀，徐 坤，巩 彪 （山东农业大学园艺科学与工程学院/作物生物学国家重点实验室/农业部黄淮地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室，山东泰安 271018 ） 摘要：【目的】生姜为无性繁殖作物，千百年来，在经历气候变迁、自然选择和人工选择过程中，其生物学 性状呈现出多方面变异，造就了许多地方品种。因此，研究生姜种质资源的遗传多样性及亲缘关系，对生姜资源 进行科学分类，为生姜种质的收集、保护和创新利用提供理论依据。【方法】采用CTAB 法提取生姜幼叶基因组DNA， 利用 SRAP （相关序列扩增多态性，sequence-related amplified polymorphism ）分子标记技术，对来源于世界 不同地区的51 份生姜种质的基因组DNA 进行多态性扩增，PCR 产物采用6%变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分离，采用银 染法显色。根据电泳结果得到“0，1”矩阵，利用POPGENE version1.32 软件计算每对引物的多态性位点数、多 态性位点百分率，以及有效等位基因数Ne、Nei’s 遗传相似系数（GS ）、遗传距离（GD ）、Nei’s 遗传多样性指数、 Shannon 信息指数等指标，并采用NTSYS version2.10e 软件进行种质间的UPGMA （非加权组平均法，unweighted pair-group method ）聚类分析和基于Nei’s 遗传距离的组群间的聚类分析，对生姜资源进行分类；同时，根据不 同生态区之间生姜种质资源的遗传多样性和亲缘关系，结合植物起源中心相关特性及历史记载，探讨生姜的起源 与传播。【结果】筛选出的15 对引物共扩增出305 条带，其中188 条为多态性条带，多态性比率为61.68%，平均 每对引物扩增出20.33 个位点和 12.53 个多态性位点，说明生姜的遗传变异较为广泛。51 份生姜种质的Nei’s 遗 传多样性指数、Shannon 信息指数平均值分别为0.3689、0.5510，据此可将生姜种质分为3个大类、9 个亚类，分析 比较发现，每一类的生姜多来源于相同或相近区域。进一步研究表明，7 个不同地理来源群体的 Shannon 信息指数 范围是0.2901—0.4807，在遗传相似系数为0.9 时，可将7 个群体分为4 类，华北群体、非洲群体各为一类，东 南亚群体与日韩群体为一类，东南沿海群体、西南高原群体、华中群体为一类。【结论】品种间基于Nei’s 遗传多 样性指数和 Shannon 信息指数的分析表明，生姜虽为无性繁殖作物，但其遗传多样性较为丰富；根据遗传相似系 数的UPGMA 聚类分析结果，生姜种质资源的遗传多样性受地理来源影响较大；群体间遗传多样性分析表明，中国 国内群体的遗传多样性高于国外群体，尤其华北群体与其他群体的遗传距离较远，且其栽培历史悠久，可以判定 中国华北地区是生姜的次生起源地；而鉴于非洲群体的遗传多样性指数较高，与其他群体的遗传距离较远，且空 间分布距中心位置较近，又有野生种存在，据此推断非洲可能是除东南亚之外的另一生姜原生起源地。 关键词：生姜；SRAP；遗传多样性分析；起源 Genetic Diversity and Phylogenetic Relationship of Ginger Germplasm Resources Revealed by SRAPs LI Xiu, XU Kun, GONG Biao (College of Horticulture Science and Engineering, Shandong Agricultural University /State Key Laboratory of Crop Biology/Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Horticultura