利用大白菜times;芜菁F2群体定位抗根肿病QTL及上位性互作分析.pdfVIP

中国农业科学 2014,47(20):4036-4044 Scientia Agricultura Sinica doi: 10.3864/j.issn.0578-1752.2014.20.012 利用大白菜×芜菁F 群体定位抗根肿病QTL及上位性互作分析 2 1 1 1 1 2 1 1 李朋朋 ，梁 珊 ，陈 兵 ，于 莎 ，张椿雨 ，司龙亭 ，朴钟云 1 2 （沈阳农业大学园艺学院，沈阳 110866； 华中农业大学植物科学技术学院，武汉 430070 ） 摘要：【目的】挖掘和分析芸薹种抗根肿病基因及基因间的互作关系，为芸薹种抗根肿病育种提供理论依据。 【方法】以大白菜自交系‘BJN’为母本，芜菁自交系‘Siloga’为父本进行杂交获得 F。F 单株自交获得由 140 1 1 个单株构成的F 群体，用于遗传图谱构建。95个F 单株及其F 家系用于抗根肿病（CR）性状的QTL定位和上位性 2 2 3 互作分析。利用 1 214 个分子标记和前人开发的与 7 个 CR 连锁的 22 个标记进行亲本间多态性筛选。根据作图群 体的多态性标记基因型，采用 JoinMap 4.0 作图软件构建遗传连锁图谱。以采自甘蓝型油菜栽培地的根肿菌对 2 个亲本及其 95 个 F 家系进行根肿病抗性鉴定。根据 F 植株的发病等级，计算 F 单株的平均发病指数（DI）。利 2：3 3 2 用 Windows QTL Cartographer 2.5 软件，采用复合区间作图法检测抗根肿病 QTL。利用基于混合线型模型的 QTL Network 2.0软件进行互作关系分析。SPSS 18.0.0软件用于分析F2 群体中QTL连锁标记的基因型与其相应个体平 均DI值间的相关性。双因素方差分析方法分析QTL连锁标记的交互作用。通过单因素方差分析，采用最小显著差 异法和q检验（SNK）多重比较QTL紧密连锁标记（sau_um026和BrID90197)组合成的9种基因型在根肿病抗性上 的差异。【结果】抗病性鉴定表明‘Siloga’对根肿菌表现为抗病，而‘BJN’表现为感病。F群体中根肿病发病 2 指数呈偏正态分布，表明根肿病抗性表现为由主效基因存在的多基因控制的数量性状。利用检测到的 261 个多态 性标记构建出一个包含 222 个标记和 10 条连锁群的芸薹种遗传图谱。该图谱总长度为 1 152.6 cM，定位了与 3 个 CR 连锁的 5 个标记，覆盖了大白菜参考基因组的88.6%。通过QTL定位共检测到源于‘Siloga’的2个QTL位 点，分别位于 A3 连锁群的主效 QTL（qPbBa3.1 ）和 A8 连锁群的微效 QTL（qPbBa8.1 ）。qPbBa3.1 和 qPbBa8.1 的 贡献率分别为 19.02%和 7.82%。qPbBa3.1 区域内包含有抗根肿病基因CRa 或 CRb，而qPbBa8.1 与 Crr1 毗邻。此 外，检测到 qPbBa3.1 和 qPbBa8.1 间的上位性互作，互作效应为加性×加性，贡献率为 6.5