梨火疫病病原菌（Erwinia amylovora）三型分泌系统的鉴别及Erwinia spp. HrpA的分析.pdfVIP

中国农业科学 2009,42(2):505-510 Scientia Agricultura Sinica doi: 10.3864/j.issn.0578-1752.2009.02.016 梨火疫病病原菌（Erwinia amylovora）三型分泌系统的鉴别 及 Erwinia spp. HrpA 的分析 1 2 1 1 朱 勃 ，金谷雷 ，怀 雁 ，谢关林 1 2 （浙江大学生物技术研究所，杭州 310029 ； 浙江大学生物信息学研究所，杭州 310029 ） 摘要：【目的】明确梨火疫病病原菌（Erwinia amylovora ）三型分泌系统（type Ⅲ secretion system， TTSS）的所在区域、相关基因及 Erwinia spp.的HrpA（hypersensitive response and pathogenicity gene A） 选择压水平。【方法】利用生物信息学方法，通过BLAST 程序对梨火疫病菌基因组的核苷酸数据库进行同源比对， 同时对Erwinia spp.与宿主互作的表面蛋白 HrpA 进行选择压分析。【结果】TTSS分析结果显示在40 kb大小的毒 力岛上有27个 TTSS相关基因。通过与看家基因及毒力岛上的致病性相关的重要基因 HrpN 的比较、选择压分析、 多序列比较，发现 HrpA 基因处于较强的选择压作用下，且 HrpA 蛋白 N 端主要受正向选择，C端主要受净化选择。 NJ法构建的 HrpA 系统发育树显示 Erwinia spp.形成两个明显的分支，表明 HrpA基因可能在种间分化后产生了不 同的选择压变化。【结论】梨火疫病病原菌基因组3.14－3.18 Mb为其TTSS分布区域。该病原菌通过TTSS侵染寄 主植物，在其病原菌表面有一种类鞭毛结构的 TTSS 蛋白 HrpA，HrpA 作为传输者起着将效应分子输送到宿主内部 的功能，在进化上受到了较强的选择压影响。 关键词：梨火疫病；三型分泌系统；HrpA；正向选择；净化选择 Identification of Type III Secration System in Erwinia amylovora and Analyse of HrpA in Erwinia spp. 1 2 1 1 ZHU Bo , JIN Gu-lei , HUAI Yan , XIE Guan-lin 1 2 ( Institute of Biotechnology, Zhejiang University, Hangzhou 310029; Institute of Bioinformatics , Zhejiang University, Hangzhou 310029) Abstract: 【Objective 】 The objective of this study was to investigate the TTSS in Erwinia amylovora and the HrpA selection pressure in Erwinia spp. 【Method 】 Bi