水稻开颖半不育突变体的观察、遗传分析和基因定位.pdfVIP

中国农业科学 2016,49(1):1-13 Scientia Agricultura Sinica doi: 10.3864/j.issn.0578-1752.2016.01.001 水稻开颖半不育突变体的观察、遗传分析和基因定位 陈立凯，黄 明，刘永柱，王 慧，陈志强，郭 涛 （华南农业大学国家植物航天育种工程技术研究中心，广州 510642 ） 摘要：【目的】通过对一份航天诱变水稻（ Oryza sativa L.）开颖半不育突变体 ohss （open-hull semi-sterility ）进行形态特性调查、遗传分析和基因定位，筛选候选基因，为下一步基因克隆和功能分析奠定 基础。【方法】以籼稻品种航恢七号为材料，通过“神舟八号”飞船搭载，诱变获得一份水稻开颖半不育突变体 ohss。对其进行形态特征解剖观察，分析颖花器官发育突变特点。调查突变体和野生型的花粉可育率、自然结实 率和套袋自交结实率，对其育性进行鉴定。随机选取 5 个成熟单株，考察穗部谷粒相关性状并进行统计分析。通 过覆盖全基因组的 SSR 分子标记检测，解析空间诱变的分子变异效应。以航恢七号、Francis 和 02428 与突变体 2 ohss 配制杂交组合，观察 F 和 F 植株的花器官表型，进行χ 测验，对突变性状进行遗传分析。以 02428/ohss 的 1 2 F2 分离群体作为目标基因定位群体，同时利用 SSR 标记以及新开发的多个 InDel 分子标记开展基因定位研究。利 用RAP水稻基因组注释数据库对定位区间的候选基因进行预测，通过序列比对和基因表达分析筛选候选基因。【结 果】开颖半不育花器官突变体 ohss 与野生型相比，抽穗期穗部明显包茎，颖花发育出现异常，内外稃片瘪弱、扭 曲变形且开裂不抱合，颖花内部发育类似内稃状的器官，部分颖花没有内稃的分化。ohss 发育异常颖花中可育花 粉率58.74%，导致单株结实率、穗重、穗实粒数与野生型相比极显著降低。全基因组SSR标记检测表明突变体 ohss 总变异频率为 0.0336，除了第 7、12 染色体未检测到突变位点，其他染色体上检测到突变频率范围为 0.0143— 0.0889。遗传分析结果显示 ohss 的开颖半不育表型受单隐性核基因 ohss(t)控制，并将 ohss(t)定位在水稻第 3 染色体上 2 个 InDel 标记 InDel6043 和 InDel6070 之间约 27.6 kb 的物理距离内。该区域有 3 个预测注释基因， 序列比对和表达分析表明突变体 ohss 的 OsMADS1 编码区及启动子序列未发生突变，但是表达模式发生强烈改变。 【结论】开颖半不育的花器官发育突变体ohss 受单隐性核基因 ohss(t)控制，ohss(t)定位在水稻第 3 染色体上 InDel6043和InDel6070标记之间约27.6 kb的物理距离内，其 OsMADS1 的编码序列及5′UTR区未发生碱基突变但 表达受到强烈抑制。 关键词：水稻；航天诱变；花器官发育；遗传分析；基因定位 Observation, Genetic Analysis and Gene Mapping of an Open Hull Semi-Sterility Mutant in Rice (Oryza sativa) CHEN Li-kai, HUANG Ming, LIU Yong-zhu, WANG Hui, CHEN Zhi-qiang, GUO Tao (National Engineering Research Centre of Plant Space Breeding, South China Agricultural University, Guangzhou 510642)