小麦TaSnRK2.10的多态性及与农艺性状的关联.pdfVIP

中国农业科学 2014,47(10): 1865-1877 Scientia Agricultura Sinica doi: 10.3864/j.issn.0578-1752.2014.10.001 小麦TaSnRK2.10 的多态性及与农艺性状的关联 1,2 2 2 2 1 2 王 倩 ，毛新国 ，昌小平 ，贾继增 ，刘惠民 ，景蕊莲 1 2 （山西大学生物工程学院，太原 030006 ； 中国农业科学院作物科学研究所/农作物基因资源与基因改良国家重大科学工程，北京 100081） 摘要：【目的】蔗糖非发酵蛋白激酶（SnRK ）是一类丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶，在植物信号传递途径中发挥着 重要作用。研究小麦TaSnRK2.10 的多态性，开发其功能标记，并进行标记-表型性状关联分析，为利用分子标记 进行遗传改良和种质创新提供依据。【方法】以 30 份多态性较高的六倍体普通小麦及其野生近缘种的二倍体和四 倍体为材料，通过测序分析 TaSnRK2.10-A 的序列多态性；利用中国春缺-四体材料对该基因进行染色体定位；利 用RIL 群体（偃展1 号×内乡188）对基因进行遗传定位；根据TaSnRK2.10-A 序列多态性，开发分子标记，以262 份普通小麦构成的自然群体为材料分析基因单倍型与表型性状的关联特性。【结果】克隆了小麦TaSnRK2.10 的A、 D 基因组序列，在由 30 份多态性较高的小麦材料组成的自然群体中，没有检测到来自 D 基因组的 TaSnRK2.10-D 序列多态性；TaSnRK2.10-A 全长4 688 bp，包括启动子1 934 bp、5′-UTR 343 bp、编码区2 319 bp 及 3′-UTR 92 bp。在基因全长序列中共检测到15 个SNP、2 个InDel。其中，启动子区有8 个SNP，5′-UTR 有2 个，编码区有5 个。位于编码区的5 个SNP 中，2 个存在于外显子，其中一个是非同义突变。2 个InDel 均位于编码区。根据序列 多态性分别设计了启动子区的分子标记PM1 和PM2，以及基因编码区的分子标记GM1 和GM2。利用中国春缺-四体 材料将TaSnRK2.10-A 定位于小麦染色体4A，利用RIL 群体将TaSnRK2.10-A 定位在染色体4A 的标记Xwpt7001 和 WMC48 之间，与2 个侧翼标记的遗传距离分别为5.1 cM 和25.7 cM。利用开发的4 个分子标记，将自然群体的262 份材料分为4 种单倍型，分别与千粒重、单株穗数和每穗小穗数显著相关或极显著相关，Hap Ⅱ和HapⅢ是提高千 粒重的优异单倍型。4 184 bp 位点为C 时，为高千粒重的优异等位变异。【结论】小麦TaSnRK2.10-A 位于染色体 4A。Hap Ⅱ和HapⅢ是提高千粒重的优异单倍型，HapⅣ是提高单株穗数的优异单倍型，4 184 bp 位点的胞嘧啶（C ） 是优异等位变异。 关键词：小麦；TaSnRK2.10 ；多态性；功能标记；单倍型；关联分析 Polymorphism of TaSnRK2.10 and Its Association with Yield-Related Traits in Wheat 1,2 2 2 2 1 2 WANG Qian , MAO Xin-guo , CHANG Xiao-ping , JIA Ji-zeng , LIU Hui-min , JING Rui-lian (1 College of Bioengineering, Shanxi University, Taiyuan 030006; 2 Institute