中国松嫩平原短芒野大麦（Hordeum+brevisubulatum（Trin.）Link.）天然种群分子遗传和表观遗传多样性及其遗传结构的研究.pdf

中文摘要 本文首次采用分子标记技术AFLP(Amplified fragmentlengthpolyInorphism)、 S—SAP MSAP (Sequence—specificamplifiedpolymorphism)和(Methylation— sensitive aII】plified 遗传多样性及遗传结构分化，并对这三种分子标记进行了比较。 采用AFLP和S—SAP分子标记对松嫩平原9短个芒野大麦天然种群遗传多样性和遗 传结构进行了分析。两种标记的各种遗传多样性指标、基因流、遗传距离、聚类分析、 PcA分析和AMOVA分析都表明，松嫩平原9个短芒野大麦天然种群遗传多样性和遗传结 构变化的趋势是一致的。松嫩平原黑龙江省齐齐哈尔地区草原分布广泛，基本没有明显 的人为干扰和山脉等地理隔离，并且适合短芒野大麦生长，其4个短芒野大麦种群的遗 传多样性偏低，遗传距离较近，基因流较高，其分布明显符合距离隔离模型；而吉林省 的5个种群都受到人类不同程度的干扰，大部分草原改为耕地或退化为重度盐碱地，形 成了人为隔离，其遗传多样性偏高，遗传距离较远，基因流较低，其分布明显符合脚踏 石模型。9个短芒野大麦天然种群分布在该物种地理分布的最东端，根据多样性分析， 表明其迁移方向应为由南向北，即从松嫩平原南部的吉林省向北部的黑龙江省扩散。很 明显，两种显性标记技术都适合高度异交短芒野大麦种群遗传多样性和遗传结构分化的 研究，而对种群样本量的要求较低，每个种群大于16株的样本量就可以代表绝大部分 种群遗传信息。但是从各种指标来看，s—sAP能检测到更多的变异，遗传多样性更高， 更适合该物种种群分子遗传学研究。 根据AFLP和s—sAP的分析结果，两种方法都把松嫩平原9个短芒野大麦天然种群 的235个单株聚为3组，从3组中分别取出8个单株来分析3组共24个短芒野大麦单 株的甲基化模式变化。很明显，松嫩平原短芒野大麦天然种群的甲基化模式具有种群特 异性，采用聚类分析，能把绝大多数单株聚到相应的组中。另一方面，通过对AFLP、s—sAP、 甲基化非敏感多态(Methylation—insensitive (Methylation—sensitive 测发现，短芒野大麦种群甲基化模式变化不仅与序列和反转座子序列变化有一定的相 关，还受其它控制系统的调控。 关键词：松嫩平原：短芒野大麦；种群遗传多样性；种群遗传结构；地理距离；遗传距 离；基因流；基因型频率；AFLP：S—SAP；MSAP；MSP；MISP Abstract Genetic arIdstructIlreof9Ⅸm_lral ofwild diversity populationsbarley(打D砘勰m ofatotalof235individuals 6阳v捃“6幽fⅣm(Tnn．)Link．)，whichencom谢sed c0Ilected行om were songnenplain 砌yzedby锄pli丘ed lengtlI 疗agment polymoIp¨sm(AFu’)， specinc-sequenceamplifiedp01ymorphism(s-SAP)andmetllylatjon—sensitiveamplined ofmeScthreemarkerswasalso polymorpllism(MSAP)mark弧Thee伍ci∞cy evaluated． of 111dices geneticdiVersi坝geneticdistance，gene aIldAMOVA fbmbomAFLPandS-SAPm