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aflp技术和粒体序列分析在我国巨蛎属牡蛎系统分类中的应用
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AFLP技术和线粒体序列分析在我国巨蛎属牡蛎
系统分类中的应用
捅姜
长期以来人们一直认为我国有四种具有经济意义的牡蛎:太平洋牡蛎
(Crassostreagigas)、褶牡蛎(Cplicacula)、近江牡蛎(c
rivularis)和大连湾牡蛎
(C
存在困难。由于这些争议的存在,有必要采用分子标记对这几种牡蛎进行区分与鉴
定。
扩增片段长度多态性技术(AFLP)是基于选择性扩增完全酶切消化后的基因
组DNA片段。该技术的运用不需要预知基因组的序列特征,具有较高的多态分辨
力,可适用于任何来源和各种复杂度的DNAs。AFLP技术被广泛地运用到动物分
子生物学的研究中。本文利用简化的AFLP技术从基因水平上对太平洋牡蛎、大连
湾牡蛎、褶牡蛎和近江牡蛎进行了初步分类鉴定和遗传多样性分析,探讨了AFLP
技术在牡蛎系统分类学上的应用。在16种引物中,筛选了8种引物对四种牡蛎的
之间。此外,还得到了4条特异性标记(太平洋2条,大连湾和近江牡蛎各1条),
可作为种的鉴定。数据处理参照RAPD标记的数据分析方法,计算了四种牡蛎群内
遗传多样性参数和种间的遗传距离。结果显示太平洋牡蛎群内遗传多样性不丰富,
间的遗传距离表明:太平洋牡蛎和大连湾牡蛎为O.2818,褶牡蛎和近江牡蛎为0.101l
图。聚类图显示,太平洋和大连湾牡蛎聚在一个组内,而近江牡蛎和褶牡蛎聚在另
一个组内。本研究结果表明,太平洋牡蛎和大连湾牡蛎应为同一种类,而近江牡蛎
和褶牡蛎的很小的遗传分歧可能表明,我们的褶牡蛎样品可能是生活于较高盐度生
境的近江牡蛎,这一点有待于进一步的工作加以证实。
DNA序列分析是检测DNA水平多态性最精确的方法,鉴于我国沿岸几种常见
牡蛎分类比较混乱的现状,利用PCR技术扩增了大连、青岛、宁波和厦门4个不
AFLP技术和线粒体序列分析在我国巨蛎属牡蛎系统分类中的应用
同地理位置的常见牡蛎168核糖体RNA和细胞色素氧化酶亚I单位(coi)基因片段,
rRNA基
测定得到的基因片段分别长度分别是488bp和649bp。在31个个体的16S
因序列中共检测到10个多态位点和四种单倍型,在60个个体的COl序列中共检测
到84个多态位点和28种单倍型,转换成氨基酸序列后,在60个个体中检测7个
多态氨基酸位点和7种氨基酸序列。4个地方群内遗传多样性参数显示:宁波和厦
门群内的遗传多样性要高于大连群体,青岛群内多样性最低。由31个个体的16S
rRNA基因序列和60个个体的COl基因片段构建的NJ系统树显示青岛、大连的个
体聚为一支,宁波、厦门的个体各自聚为一支,说明各地理位置的牡蛎有不同的遗
传差异。以大连湾牡蛎、太平洋牡蛎、近江牡蛎和美洲牡蛎为外群构建了NJ和MP
系统树,16S和COl的结果一致。系统树显示,大连和青岛牡蛎单倍型和太平洋和
大连湾牡蛎的单倍型总聚在一个组内,而宁波牡蛎和近江牡蛎也总聚在一起,而所
有厦门单倍型和个别大连湾牡蛎(不超过2个)的单倍型聚在一起。氨基酸的系统
树上分成三大支:大连、青岛和厦门与大连湾牡蛎和太平洋牡蛎构成一支;宁波和
近江牡蛎构成另外一支;美洲牡蛎为一支。结果表明在我国沿岸从北到南允布广泛
的,形态颇相似的被认为是“褶牡蛎”的小型牡蛎名称不准确,而且并不是单一种
类,而包括几种不同的牡蛎:很可能至少一种是太平洋牡蛎(青岛和大连),一种
是生活于较高盐度生境的近江牡蛎(宁波)a
分子标记在牡蛎鉴别与系统分类研究方面,有强大的说服力,如果可以在牡蛎
的分类研究中综合形态学、细胞学和分子系统学等多方面的证据,将会对牡蛎的系
统分类提供一个更完美的解释。
rRNA基因COI基因分子系统学
16S
关键词:AFLP
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AFLP and
mitochondrialDNA
technique
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