拟南芥肉桂酰辅酶A还原酶_AtCCR1_2_基因生物信息学分析_刘晓晶.pdfVIP

拟南芥肉桂酰辅酶A还原酶_AtCCR1_2_基因生物信息学分析_刘晓晶.pdf

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DOI :10.15983/ki .jsnu.2011.03.011 第39 卷 第3 期 陕西师范大学学报(自然科学版) Vol.39 N o.3  2011 年5 月 Journal of Shaanxi Normal U niversity (Natural Science Edition) M ay.2011  :1 72-4291(2011)03-00 7-0 A (A tCCR 1/2) 刘晓晶,  崔浪军,  夏 飞,  杨章民* ( ; ; , 7100 2)  :用生物信息学方法分别对拟南芥等植物 两种肉桂酰辅酶A 还原酶(CCR )基因序列相似 性、编码产物理化性质、三级结构、亚细胞定位、启动子序列、基因表达量以及功能进行预测和分析. 结果表明, CCR 1和 CCR 2 基因序列、编码产物理化性质和三级结构相似性均较高, 编码产物可能 定位于细胞质.A tCCR 1 在拟南芥整株植物和各个器官 的的表达量均远比A tCCR 2 的高.不同因 素处理下A tCCR 1 和A tCCR 2 表达状况差异较大, 这可能与二者启动子区域含有的顺式作用元件 不同有关. :拟南芥;肉桂酰辅酶A 还原酶;基因表达;生物信息学 :Q554.9 : A Bioinformatic analysis of Cinnamoyl CoA reductase (A t CCR 1/2)gene from Arabidop sis thal iana * LIU Xiao-jing, CUI Lang-jun, XIA Fei, YANG Zhang-min (College of Life Science;Shaanxi Normal University;Key Laboratory of the Ministry of Education for Medicinal Resources and N atural Pharmaceutical Chemistry ;National Engineering Laboratory for Resource Development of Endangered CrudeDrugs in Northw est of China;Xi′an 7100 2, Shaanxi, China) Abstract:Some characteristics of the cinnamoyl CoA reductase (CCR )genes w ere analyzed and predicted by the tools of bioinformatics.The characteristics w ere as follow s:nucleic acid sequence similarity, promotor sequence, gene expression and function, as w ell as physical and chemical properties, tertiary structure and subcellular localization of CCR protein.The results show ed that A tCCR 1 and A tCCR 2 sequence, physical and chemical properties, tertiary structure of the tw o CCR protein w ere highly similar to that of other plant CCR.The tw o CCR proteins located to cytoplasm.A tCCR 1 gene expressio

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