应用基因芯片技筛选先天性巨结肠相关基因的研究.pdf

应用基因芯片技筛选先天性巨结肠相关基因的研究.pdf

应用基因芯片技筛选先天性巨结肠相关基因的研究

目录 英文缩略词注解 1 中文摘要 2 ABSTRACT 4 前言 6 材料与方法 10 1 实验材料 10 1.1 组织取材 10 1.2 基因芯片 10 1.3 主要试剂和仪器 10 1.4 数据处理软件 11 2 实验方法 12 2.1 实验流程 12 2.2 样品制备 12 2.3 实验方法 13 2.4 数据分析 17 2.5 差异表达基因的生物信息学初步分析 17 结果 19 1 本院病理科部分先天性巨结肠及切缘组织病理结果 19 2 标本RNA 质检结果 19 3 基因芯片检测结果 21 4 RT-PCR 验证结果: 30 讨论 31 1.筛选到的差异表达基因 32 1.1 微管蛋白β-2B (TUBB2B )在神经发育过程中的作用 32 1.2 神经降压素(NTS )与神经降压素受体1 (NTSR1 ) 34 1.3 原癌基因RET 37 2.展望 38 结论 40 参考文献 41 综述 46 攻读学位期间的研究成果 59 致谢 60 英文缩略词注解 英文缩写 英文全称 中文全称 HD Hirschsprung disease 先天性巨结肠 RET ret proto-oncogene 原癌基因RET GDNF glial cell derived neurotrophic factor 胶质细胞源性神经营养因子 EDNRB endothelin B receptor 内皮素B 受体 EDN3 endothelin3 内皮素3 ECE1 endothelin converting enzyme 1 内皮素转换酶1 NTN neurturin 神经营养蛋白 SOX10 SRY (sex determining region Y)-box 10 SOX10 蛋白 PHOX2B paired-like homeobox 2b 配对同源异型框2b 基因 NRG1 neuregulin 1 神经调节蛋白1 lincRNAs large intergenic noncoding RNAs 新型长链非编码RNAs SAM significance analysis of microarray 芯片差异显著性分析 GO Gene ontology 基因注释 SOX11 SRY (sex determining region Y)-box 11 SOX11 蛋白 NTNG2 netrin G2 神经生长因子G2 EDNRA endothelin receptor type A 内皮素A 受体 NTN1 n

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