东方鲀生长激素基因内含子2的克隆和多态性分析.pdfVIP

HEREDITAS (Beijing) 2007 11 , 29(11): 1378―1384 ISSN 0253-9772 研究报告 DOI: 10.1360/yc-007-1378 鲀2 黄军, 严美姣, 陈国宏, 许盛海, 鞠慧萍, 程金花, 吴云良 225009 鲀 鲀 鲀 : 以暗纹东方 (Takifugu obscurus) 、红鳍东方 (Takifugu rubripes) 、星点东方 (Takifugu niphobles)共82 个个体为对象，运用PCR 产物电泳检测、单链构向多态性(SSCP)技术和克隆测序技术检测到生长激素(Growth Hormone, GH)基因内含子2 的长度和序列多态性。结果表明，3 个群体中GH 基因内含子2 存在9 种长度类型， 分别为A 、B 、C、D 、E 、F 、G、H 、I ，变异频率达到24.22 ％。对这9 种序列进行比对分析，(1)发现 9 种长 度类型A 、G 、T 、C 的平均百分比为17.15 ％、20.77 ％、37.38 ％、24.70 ％，其中G+C(45.47 ％)含量与A+T(54.53%) 的含量差异不显著；(2)9 种序列分别长351 bp 、327 bp 、319 bp 、303 bp 、295 bp 、291 bp 、287 bp 、283 bp 和 271 bp ，引起长度变化的主要原因是短串联序列TCTG 的重复 ( 重复次数从20 到40 不等); (3)发现4 个突变位 点，其中3 个转换位点为 83(C →T) ，101(A →G)296(G →A) ，一处颠换位点 103(C→A) 。用UPGMA 法构建分 子系统树，发现DD 与II 首先聚为一类，然后依次与GG、AA 聚为一大类，BB 与CC ，EE 与HH 分别聚为一 类，最后再与FF 聚为一大类，由此可见GH 基因内含子2 在品种间的差异远大于品种内差异。 鲀 : 东方 ；生长激素基因；内含子；多态性 Cloning and polymorphism analysis of intron 2 of the GH gene in Takifugu HUANG Jun, YAN Mei-Jiao, CHEN Guo-Hong, XU Sheng-Hai, JU Hui-Ping, CHENG Jin-Hua, WU Yun-Liang College of Animal Science and Technology, Yangzhou University, Yangzhou 225009, China Abstract: Size and nucleotide polymorphisms of intron 2 of the growth hormone (GH) gene was studied in 82 individuals from Takifugu obscurus, Takifugu rubripes and Takifugu niphobles with PAGE, SSCP and cloning. Results showed that there were nine length variants (A~I) in these fishes, ranging from 271 351 bp, with a frequency of variation of 24.22%. Sequence analysis of the 9 length variants showed the average percentages of the four bases (ATG and C) were 17.15 , 20.77 , 37.38 and 24.70 , respectively, and the difference between GC content (45.47 ) and AT content (54.53 ) was not remarkable. Length variation was