蛋白质的序列分析及结构预测解析.ppt

1. 蛋白质序列信息的获取 （1） 直接测序 （2） 翻译编码的DNA序列 ORF Finder （3）在数据库中搜索 运用ID 号、入口号、条目号等搜索。 运用关键词搜索 其他方式搜索。如可以通过引用序列的文献、序列的作者、序列提交的日期等进行搜索。 （1）直接测序 串联质谱及其作用 串联质谱仪的组合方式： (1) 磁分析器-静电分析器-磁分析器(2) 静电分析器-磁分析器-静电分析器(3) 三重四极滤质器质谱仪(4) 混合式串联质谱仪，如MA-ESA-Q-Q。实现串联质谱有空间串联和时间串联两种方式。 优点： 可以避免底物分子产生的干扰，大大降低背景噪音。 其次，可使分子离子通过与反应气的碰撞来产生断裂。 因此能提供更多的结构信息，所以串联质谱特别适合 于复杂组分体系且干扰严重的样品中低含量组分分析测 定，具有比GC-MS和LC-MS等一级质谱更高的选择性和灵 敏度。 Masses of Amino Acid Residues Protein backbone Breaking Protein into Peptides and Peptides into Fragment Ions Proteases, e.g. trypsin（胰蛋白酶）, break protein into peptides. A Tandem Mass Spe