6份狼尾草属菌草的ITS和叶绿体matK序列分析.pdfVIP

福建农林大学学报 (自然科学版) 第 44卷 第 2期 JournalofFujianAgricultureandForestryUniversity(NaturalScienceEdition) 2015年 3月 6份狼尾草属菌草的ITS和叶绿体matK序列分析 林雄杰 ，范国成 ，林冬梅 ，林 辉 ，胡菡青 ，鲁国东 ，林 占熔 (1．国家茵草工程技术研究中心，福建 福州350002；2．福建省农业科学院果树研究所，福建福州350013) 摘要：对来 自福建农林大学、闽清、闽侯和南平等地的6份狼尾草属菌草的ITS片段和叶绿体marK基因序列进行测定，并 用ClustalX2．0和MEGA4．1软件对其进行比对分析，构建系统发育树．结果表明，6份菌草的ITS序列长度均为585bp，其 中变异位点0—3个，信息位点2个，遗传距离为0一O．089，平均遗传距离为0．022；marK序列长度为8go一881bp，其中变异 位点(信息位点)1个，遗传距离为0—0．016，平均遗传距离为0．010．ITS系统树结果显示6份共菌草聚成四类，其中杂交狼 尾草和象草(MQ)聚类在第 1类的同一分支，巨菌草和象草聚在第 Ⅱ类的不同分支，表明其亲缘关系比较近；marK序列系统 树结果除了象草(MQ)外其余5份菌草均聚在了同一分支上，表明叶绿体marK序列无法将供试的6份菌草区分开． 关键词：ITS序列；marK基因；菌草；序列分析 中图分类号：Q943．2 文献标识码：A 文章编号：1671-5470(2015)02-0174-07 DOI：10．13323／j．cnki．j．fafu(nat．sci．)．2015．02．012 SequenceanalysisonITSandchloroplastmatK geneofsixPennisetum JUNCAo LINXiong-jie’，FANGuo—cheng，LINDong—mei，LINHui，HUHan—cling，LUGuo—dong，LINZhan—xi (1．NationalJUNCAOEngineeringTechnologyResearchCenter，Fuzhou，Fujian，350002，China；2．FruitResearch Institute，FujianAcademyofAgriculturalSciences，Fuzhou，Fujian350013，China) Abstract：ITSsequencesandchloroplastmarKgeneof6PennisetumJUNCAOwhich’verefromFujianAgricultureandForestryUni— vemity，Minqing，MinhounadNnapingwere sequenced，comparedandanalyzedwithClustalX2．0nadMEGA4．1softwaresnada phylogenetictreeWrit8consturcted．ItwasshownthatthelengthofITSsequenceswas585bp．including0to3variablesitesnad2 informationsites．Thegeneticdistnaceswere0to0．089．averaging0．022．ThelengthofmarKgenein6JUNCAOwasbetween880 bpnad881bpincluding1variablesite(informationsite)．ThegeneticdistanceWaS0to0．016，averaging0．010．SixJUNCAO wereclusteredintofourgroupsinITSphylogenetictree，Pennisetumgianteum linnadPennisemm purpureum，Pennisetum sp．Laimu一 1nadJP．purpureum (MQ)wereclusteredintothegroupInadgroupⅢ，respectively．ItwasvisiblefromthematKphylogenetic treethat5JUNCAOwereclusteredintothesan!ebranchexcept