第五节数量性状基因座讲解.pptVIP

前言 第五节 数量性状基因座 一、QTL定位的原理和步骤 QTL定位的原理 图 8-5 QTL定位的基本原理示意图 QTL定位的步骤 构建作图群体 确定和筛选遗传标记 检测分离世代群体中每一个体的标记基因型 测量数量性状 统计分析 QTL定位的步骤 QTL定位的步骤 常用的分子标记 QTL定位的步骤 表8-6 水稻窄叶青8×京系17F2群体部分数量性状值与RFLP标记基因型值 QTL定位的步骤 二、QTL定位的统计方法 二、QTL定位的统计方法 二、QTL定位的统计方法 区间定位法 二、QTL定位的统计方法 三、QTL分析的应用前景 分子标记辅助选择 Marker—assisted Selection，MAS * * * 第五节 数量性状基因座 (QTL) 第八章 数量性状的遗传 质量性状和数量性状的区别 质量性状 数量性状 ①． 变异类型 种类上的变化 （ 如红、白花 ） 数量上的变化 （ 如种子产量 ） ②． 表现型分布 不连续 连续 ③． 基因数目 一个或少数几个 微效多基因 ④． 对环境的敏感性 不敏感 敏感 ⑤． 研究方法 系谱和概率分析 统计分析 经典数量遗传分析法 分析控制数量性状表现的众多基因的综合遗传效应，但是无法鉴别基因的数目、单个基因在染色体上的位置和遗传效应。 作物分子标记+数量性状基因座（QTL）定位分析法 确定影响某一数量性状的基因在染色体上的数目、位置及其遗传效应。 一、QTL定位的原理和步骤 二、QTL定位的统计方法 三、QTL分析的应用前景 QTL（quantitative trait loci）：全称数量性状基因座，它指的是控制数量性状的基因在基因组中的位置。 QTL定位：也称QTL作图；借助分子标记，可以在染色体上检测出QTL，并可以确定影响某一数量性状的QTL在染色体上的数目、位置和遗传效应。 如果分子标记覆盖整个基因组，控制数量性状的基因( Qi)两侧会有相连锁的分子标记( M i-?和 M i+?),这些与Qi紧密连锁的分子标记将表现不同程度的遗传效应。 利用分子标记定位QTL（Qi），实质就是分析分子标记与数量性状基因座Qi的连锁关系，即利用已知座位的分子标记来定位未知座位的Qi，通过分子标记与Qi之间的重组率，来确定Qi的具体位置。 单标记和单基因 MQ不连锁 MQ连锁 （1）构建作图群体 适于QTL作图的群体是待测数量性状存在广泛变异，多个标记位点处于分离状态的群体。一般是由亲缘关系较远的亲本间杂交，再经自交、回交等方法构建。 常用的群体有F2群体、回交（BC）群体、双单倍体（doubled haploids, DH）群体，重组近交系（recombinant inbred lines, RIL）群体等。其中DH群体和RIL群体可以永久使用。 （2）确定和筛选遗传标记 理想的作图标记应具备以下4个特征： 数量丰富 多态性好 中性 共显性 形态学标记（morphological marker） 蛋白质标记(protein marker) 分子标记(molecular marker)：或DNA标记。 SSR Simple sequence repeat 微卫星 （简单序列重复） VNTR Variable number of tandem repeat 可变数目串联重复 RAPD Random amplified polymorphism DNA 随机扩增多态DNA AFLP Amplified frangment length polymorphism 扩增片段长度多态性 RFLP Restriction fragment length polymorphism 限制性长度片段多态性 英文缩写 英文名称 中文名称 （3）检测分离世代群体中每一个体的标记基因型 用多态性分子标记检测分离世代群体中每一个体（系）的标记基因型值。 各种分子标记最后显示的都是电泳分离的带谱，所以个体的标记基因型需要将每个标记的带纹与亲本比较并赋值来记录，例如在共显性情况下，作图群体中应含有P1，P2和杂合型3种带型，这3种带型即代表某一分子标记的3种基因型。 如果将含有P1带型的个体赋值为1，P2带型的赋值为3，杂合体赋值为2，