第一讲~创造数学模型源于心中的朴素模型解析.pptVIP

创造数学模型源于心中的朴素模型 举例漫谈 2013-06-26 心中的朴素模型 每个人心中都有不同的朴素模型，盘点一下还是很可观的。 你学过任何数学知识都是朴素模型， 你学过任何生活中的物体都可以作为心中的朴素模型。 我们先举例，然后你再课下自己盘点到底有哪些朴素模型了？ 案例展示 Case1 mRNA 是翻译蛋白的蓝图，是一种四个字符组成的特殊单链序列，任何一个蛋白必然有一个mRNA与之对应。那么由生物学铁定的事实“兼并”规则： 案例展示 Case1 案例展示 Case1 Case2: micro RNA 近几年来，人们从一度被认为是没有用途的非编码区中发现了一些身手不凡的“小小兵”， 称为 micro RNA, 简称miRNA. 它们是非常保守的片断，不但自己不转录成蛋白，而且还阻止其他序列转录。由于它们个体小，通常是21-25nt，因此在进化过程中一直保持稳定的状态，也就是说，它们在生物进化过的程中是保守的。 由于, 碱基的互补性:A:C; G:U (G:T)。导致miRNA有能力攻击以单链形式出现的mRNA。它们通过碱基互补的力量与mRNA 中的适当的片断互补配对，诱导mRNA降解或者阻止了该mRNA转录为蛋白。 mRNA 的降解意味着相应的蛋白表达数量有可能减少。而某些功能蛋白的数量减少直接会表现出来与疾病联系。例如在一些细胞信号转导通路上的功能蛋白减少，会影响上下游蛋白的功能的履行，导致肿瘤成因。反之，由于某些蛋白表达量过高，也会导致肿瘤，那么使用miRNA抑制它，也可以达到抑制肿瘤的目的。 基于miRNA-21做出的基因芯片中，也显示出了随胶质瘤的级别增长表达提高。 miRNA绑定mRNA的模式 miRNA作用在mRNA上（通过碱基的互补的力量来实现结合），我们给出一个直观的解释，如图所示。 植物和动物中绑定模式的差异 文献（Sungroh Yoon 博士论文）中提出：植物和动物中，miRNA与mRNA作用的机理不完全相同，动物的情况非常复杂。因此我们先限制在特殊情形：21nt 彼此完全互补配对，且相应的mRNA 被降解。 能够发酵出什么样的重大问题 它到底能够发酵出什么样的重大问题？我们可以提出以下研究问题： 考虑miRNA与mRNA的关系如下： 对于给定的miRNA，预测所有能够被miRNA 绑定的目标mRNA。 对于给定的mRNA，预测能够绑定mRNA的所有miRNA。 进一步发酵的问题 进一步发酵的问题 案例展示 Case3 ：水桶原理 水桶原理：两只同样形状的水桶的容积的大小，取决于它们的梆子是否整齐。 水桶原理的应用 水桶原理的应用 水桶原理的应用 Case4：Transportation Logistics Transportation Logistics（运输与物流） Planning Models for Emergency Medical Services Operations (关于医疗应急措施的若干模型) Partner: City of Edmonton （参加单位：Edmonton 市） Institution: University of Alberta （主持机构：Alberta 大学） 问题叙述 该计划的目的是研究这样一些策略使得重新调整埃德蒙顿（Edmonton）市的救护车布局。该实习计划的主要目标是在提高效率的前提下，尽可能使得救护队伍的工作量最小化。基于这个目的，首先要针对某个试点区所提出的新的解决方案进行计算机仿真模拟来评估效果。然后将其它地区自身的特点加入后再估计相应的变化。第二步是开发新的实用模型来分析和改进救护车的动态调整布局策略。该结果应该为这样的一个模型，其可以适合于针对即兴提出的变化来提高效率或者减少工作量。 Case5：Green Energy Generation（绿色能源） Optimization of the SyncWave Power Resonator（兴波功率共鸣器的最优化） Partner: SyncWave Energy Inc. （合作单位：兴波能源（SyncWave Energy）公司） Institution: University of Victoria （承担单位：维克托利亚大学） 问题叙述 兴波能源（SyncWave Energy）公司是一个海浪能转换技术开发商。2008年，为了维修那些分散安装在海岸边海浪发电机兴波公司致力于开发小型商用兴波牌功率共鸣器（称为夏洛特）。本次实习计划的目的就是使用最优化分析手段找出一种方法，通过对控制系统的技术改进使得该公司现有的原型海浪发电机能够尽可能吸收到最大的浪能。这种改进的可行性来自于原型发电机对于低频海浪（指的是冬季海洋条件）的转换率预测可以提高到两倍。该公司计